RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 OLAHQ9NV23 265 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 SEMA5BQ9P283 1151 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 ATXN10Q9UBB4 475 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 TRIM10Q9UDY6 481 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 NDOR1Q9UHB4 597 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 RWDD2AQ9UIY3 292 aa5□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 HIF3AQ9Y2N7 669 aa5□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 OR52A4PA6NMU1 304 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 TMEM150CB9EJG8 249 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 E7EQ34 232 aa4.99□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 KCNN4O15554 427 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 CCP110O43303 1012 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 PGRP06401 933 aa4.99□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 DRD2P14416 443 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 UCHL3P15374 230 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 TNFAIP3P21580 790 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 CDH3P22223 829 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 CA5AP35218 305 aa4.99□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 TSFMP43897 325 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 MASP1P48740 699 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 SPINT3P49223 89 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 STC1P52823 247 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 DRG2P55039 364 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 SOX8P57073 446 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 MAXP61244 160 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 PPP2R2AP63151 447 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 TRAF2Q12933 501 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 PKP1Q13835 747 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 NCF4Q15080 339 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 MAN2A1Q16706 1144 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 SMTNL2Q2TAL5 461 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 ANO6Q4KMQ2 910 aa4.99□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 CRB2Q5IJ48 1285 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 CCDC70Q6NSX1 233 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 VHLLQ6RSH7 139 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 TMCO3Q6UWJ1 677 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 RFLNAQ6ZTI6 216 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 NLRC3Q7RTR2 1065 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 MRGPREQ86SM8 312 aa4.99□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 OOSP2Q86WS3 158 aa4.99□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 ATPAF2Q8N5M1 289 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 SLC38A9Q8NBW4 561 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 PPP4R1Q8TF05 950 aa4.99□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 ZFPM2Q8WW38 1151 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 NACC2Q96BF6 587 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 MGME1Q9BQP7 344 aa4.99□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 P4HTMQ9NXG6 502 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 PCSK1NQ9UHG2 260 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 TTLL3Q9Y4R7 772 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 CROCCQ5TZA2 2017 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 A0A0U1RQS6 177 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 DYTNA2CJ06 578 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 OR6C74A6NCV1 312 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 OR5K3A6NET4 321 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 ANKRD66B4E2M5 251 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 AGPSO00116 658 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 MATN2O00339 956 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 CHUKO15111 745 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 ZNF749O43361 778 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
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