RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431803.2

CDC42-IT1-201, CDC42 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42-IT1, Length 692 nt, Biotype sense intronic.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CFAP206Q8IYR0 622 aa9.15□□□□□ -0.94
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.15□□□□□ -0.94
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC38A9Q8NBW4 561 aa9.15□□□□□ -0.94
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CLEC18CQ8NCF0 446 aa9.15□□□□□ -0.94
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ACVR1CQ8NER5 493 aa9.15□□□□□ -0.94
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.15□□□□□ -0.94
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SEC14L1Q92503 715 aa9.15□□□□□ -0.94
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DCUN1D1Q96GG9 259 aa9.15□□□□□ -0.94
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa9.15□□□□□ -0.94
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PPM1MQ96MI6 270 aa9.15□□□□□ -0.94
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LRFN5Q96NI6 719 aa9.15□□□□□ -0.94
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PITPNM3Q9BZ71 974 aa9.15□□□□□ -0.94
CDC42-IT1-201ENST00000431803 COG4Q9H9E3 785 aa9.15□□□□□ -0.94
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TLK1Q9UKI8 766 aa9.15□□□□□ -0.94
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa9.15□□□□□ -0.94
CDC42-IT1-201ENST00000431803 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa9.15□□□□□ -0.94
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CCL22O00626 93 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 POLBP06746 335 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PSMA3P25788 255 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ACRV1P26436 265 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MC4RP32245 332 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RORAP35398 523 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CETN2P41208 172 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CD151P48509 253 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF75DP51815 510 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 VAV2P52735 878 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RPS18P62269 152 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMPRSS15P98073 1019 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ABRQ12979 859 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RPA4Q13156 261 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GPS2Q13227 327 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SEMA5AQ13591 1074 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IL10RAQ13651 578 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SPARCL1Q14515 664 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGFBP7Q16270 282 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF789Q5FWF6 425 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 COLEC12Q5KU26 742 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMTC4Q5T4D3 741 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IZUMO3Q5VZ72 239 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ARMC6Q6NXE6 501 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RAD9BQ6WBX8 426 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MICALCLQ6ZW33 695 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SYVN1Q86TM6 617 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM126BQ8IUX1 230 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR4E2Q8NGC2 313 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 THAP4Q8WY91 577 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TLR10Q9BXR5 811 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRIM55Q9BYV6 548 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM96AQ9H5X1 160 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 VPS37BQ9H9H4 285 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C1GALT1Q9NS00 363 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KCND1Q9NSA2 647 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SOHLH2Q9NX45 425 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa9.14□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MROH6A6NGR9 719 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BTN3A3O00478 584 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BTN3A1O00481 513 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DNAJB5O75953 348 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 METTL18O95568 372 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AP2A1O95782 977 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PDGFAP04085 211 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GSTM1P09488 218 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRSS56P0CW18 603 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PDHA2P29803 388 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CD97P48960 835 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GSDMDP57764 484 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RPS15P62841 145 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GSTM4Q03013 218 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRKAA1Q13131 559 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KRT33BQ14525 404 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PARP6Q2NL67 630 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CPZQ66K79 652 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ASB18Q6ZVZ8 466 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SERPINA9Q86WD7 417 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PIANPQ8IYJ0 282 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DSELQ8IZU8 1212 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CLDN19Q8N6F1 224 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM71DQ8N9W8 422 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ACRBPQ8NEB7 543 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR52E1Q8NGJ3 308 aa9.13□□□□□ -0.95
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC35B2Q8TB61 432 aa9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms