RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 OR52E1Q8NGJ3 308 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 FCRL4Q96PJ5 515 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 KIFC1Q9BW19 673 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 TSSK1BQ9BXA7 367 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 SRMSQ9H3Y6 488 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 CHRAC1Q9NRG0 131 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 TREX1Q9NSU2 369 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 POMT2Q9UKY4 750 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 SPTBP11277 2137 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 MAGEB16A2A368 324 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 J3QKU1 62 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 BTN3A3O00478 584 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 CCNYL3P0C7X3 344 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 CCR10P46092 362 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 POLE2P56282 527 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 NFKB2Q00653 900 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 MC1RQ01726 317 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 PRKG2Q13237 762 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 BRD3Q15059 726 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 NAPRTQ6XQN6 538 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 CARFQ8N187 725 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 ELMO1Q92556 727 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 HGH1Q9BTY7 390 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 ADNPQ9H2P0 1102 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 MVB12BQ9H7P6 319 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 LHX9Q9NQ69 397 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 PADI1Q9ULC6 663 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 BTRCQ9Y297 605 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 NEU2Q9Y3R4 380 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 GSAPA4D1B5 854 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 BTN3A1O00481 513 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 SLC28A2O43868 658 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 OR1I1O60431 355 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 MT-ND3P03897 115 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 NTRK1P04629 796 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 CDH3P22223 829 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 DEFB109BQ30KR1 87 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF534Q76KX8 674 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 FAM117AQ9C073 453 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 SLC25A18Q9H1K4 315 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 XKR8Q9H6D3 395 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 C1GALT1Q9NS00 363 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 CATSPERZQ9NTU4 200 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 SOHLH2Q9NX45 425 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 MATN2O00339 956 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 PFDN6O15212 129 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 KATNA1O75449 491 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 GNG11P61952 73 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 TUBB4BP68371 445 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 KCNAB2Q13303 367 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 TUBB2AQ13885 445 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 SEMA3AQ14563 771 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 TMTC4Q5T4D3 741 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 LRRC6Q86X45 466 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 CT55Q8WUE5 264 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 SLCO2A1Q92959 643 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 RUNDC3BQ96NL0 473 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 SOX13Q9UN79 622 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 SPTA1P02549 2419 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 SLC5A10A0PJK1 596 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 PAMP19021 973 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 ACADLP28330 430 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 VPS41P49754 854 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 DNASE1L3Q13609 305 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 AMIGO1Q86WK6 493 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 OR5AR1Q8NGP9 310 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 CPT1BQ92523 772 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 KCND1Q9NSA2 647 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 RNF14Q9UBS8 474 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 KCND3Q9UK17 655 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 USP27XA6NNY8 438 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 FURINP09958 794 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 ST6GAL1P15907 406 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 MGAT1P26572 445 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 ERV3-1Q14264 604 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 MRNIPQ6NTE8 343 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-201ENST00000378543 RUFY1Q96T51 708 aa22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms