RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368147.8

SPTA1-201, Transcript of spectrin alpha, erythrocytic 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTA1, Length 7,999 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Dendrite .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1-201ENST00000368147 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 NOD2Q9HC29 1040 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 DKKL1Q9UK85 242 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 DHRS7Q9Y394 339 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 KIF13AQ9H1H9 1805 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 PEX14O75381 377 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 CLEC3AO75596 197 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 MLYCDO95822 493 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 SERPINE1P05121 402 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 SLC7A1P30825 629 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 CDH13P55290 713 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 TCEAL6Q6IPX3 200 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 TRIM40Q6P9F5 258 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 RNF157Q96PX1 679 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 GPR174Q9BXC1 333 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 COL20A1Q9P218 1284 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 SRRDQ9UH36 339 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.96□□□□□ -1.29
SPTA1-201ENST00000368147 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 GLI1P08151 1106 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 DLSTP36957 453 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 GRIA3P42263 894 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 NAGLUP54802 743 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 WNT3AP56704 352 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 PPP2R2BQ00005 443 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 MPP1Q00013 466 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 DEFA5Q01523 94 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 RIPK1Q13546 671 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 CCDC58Q4VC31 144 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 ANKRD46Q86W74 232 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 OR52J3Q8NH60 311 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 APOPT1Q96IL0 206 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 C2CD2Q9Y426 696 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 UGT2B17O75795 530 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 EOMESO95936 686 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 ICAM3P32942 547 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 RGS19P49795 217 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 FAM189A2Q15884 450 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 RTL4Q6ZR62 310 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 HEXDCQ8WVB3 486 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 EDARQ9UNE0 448 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 TIMM22Q9Y584 194 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 H3BQ06 376 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 MFSD11O43934 449 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 IFNA2P01563 188 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 GKP32189 559 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 C1QTNF8P60827 252 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 MCL1Q07820 350 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 NTRK3Q16288 839 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 MAPK14Q16539 360 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 CHST4Q8NCG5 386 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 SLC22A8Q8TCC7 542 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 FATE1Q969F0 183 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 MKL1Q969V6 931 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 SGIP1Q9BQI5 828 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 LHX5Q9H2C1 402 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 THAP1Q9NVV9 213 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 TMEM216Q9P0N5 145 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 J3QR89 54 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 INSIG1O15503 277 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 APOC2P02655 101 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 OTX2P32243 289 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTA1-201ENST00000368147 GCNT1Q02742 428 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms