RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL7Q8IXQ5 586 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D21Q8IYX1 336 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5K2Q8NHB8 316 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASZ1Q8WWH4 475 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIGLEC10Q96LC7 697 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 BIRC8Q96P09 236 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 XKR8Q9H6D3 395 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGEB16A2A368 324 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 MATN2O00339 956 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 STK17BO94768 372 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 APOA4P06727 396 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 EBLN1P0CF75 366 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGF5P12034 268 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOLR1P15328 257 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 IVDP26440 423 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMED2Q15363 201 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEPROQ6NW34 567 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 CENPUQ71F23 418 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 AMIGO1Q86WK6 493 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 CILP2Q8IUL8 1156 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 CARFQ8N187 725 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF31Q96EP0 1072 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 PANX3Q96QZ0 392 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCF12Q99081 682 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSAPA4D1B5 854 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP1O94782 785 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLCO2B1O94956 709 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 F7P08709 466 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF28P17035 718 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUBB3Q13509 450 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL11RAQ14626 422 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 IZUMO3Q5VZ72 239 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF470Q6ECI4 717 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOOK3Q86VS8 718 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 NLGN4XQ8N0W4 816 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 D2HGDHQ8N465 521 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELMO2Q96JJ3 720 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 PITPNM3Q9BZ71 974 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLG2Q9UHN1 485 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLAGL1Q9UM63 463 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTRCQ9Y297 605 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATRXP46100 2492 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 NIPSNAP2O75323 286 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDH3P22223 829 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 FMO4P31512 558 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHMT2P34897 504 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARL4DP49703 201 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADARP55265 1226 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSD11B2P80365 405 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 DR1Q01658 176 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF789Q5FWF6 425 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL22RA1Q8N6P7 574 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 RUNDC3BQ96NL0 473 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM51Q9BSJ1 452 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ULBP3Q9BZM4 244 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 TWSG1Q9GZX9 223 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1GALT1Q9NS00 363 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRYL1Q9Y2S2 319 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 C2orf74A8MZ97 194 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC188H7C350 402 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 BANF1O75531 89 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIAF1O95411 115 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 ESR1P03372 595 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIFP15018 202 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACY1Q03154 408 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAP7Q14244 749 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 MSS51Q4VC12 460 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYB5D1Q6P9G0 228 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCSK4Q6UW60 755 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 UNC5DQ6UXZ4 953 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 UNC5AQ6ZN44 842 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCGF5Q86SE9 256 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1R3BQ86XI6 285 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASGRP3Q8IV61 690 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 DENND6AQ8IWF6 608 aa18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms