RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 SNX3O60493 162 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 CRHR1P34998 444 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 TIE1P35590 1138 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 CEP97Q8IW35 865 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 HMGB4Q8WW32 186 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 SLC35C1Q96A29 364 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 SLC35G5Q96KT7 338 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 PEX12O00623 359 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 DHX15O43143 795 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 MT-ND1P03886 318 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 ALPPP05187 535 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 ABHD2P08910 425 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 TACSTD2P09758 323 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 MPP1Q00013 466 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 CAPSQ13938 189 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 TEX44Q53QW1 395 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 C2orf27AQ580R0 203 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 SLC24A5Q71RS6 500 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 STRADAQ7RTN6 431 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 AMZ2Q86W34 360 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 HMCESQ96FZ2 354 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF226Q9NYT6 803 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 B4DGG1 531 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 NDST3O95803 873 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 CXCR1P25024 350 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 MAN2A2P49641 1150 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 PRKCDQ05655 676 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 FOXRED2Q8IWF2 684 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 SLC22A8Q8TCC7 542 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 IPPKQ9H8X2 491 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 INSIG1O15503 277 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 FAM155BO75949 473 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 PROKR2Q8NFJ6 384 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 TRMOQ9BU70 441 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 TSPAN4O14817 238 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF101Q8IZC7 436 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 AZIN2Q96A70 460 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 ATXN10Q9UBB4 475 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 DERAQ9Y315 318 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 INMTO95050 263 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 BORCS5Q969J3 196 aa16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 DACT2Q5SW24 774 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 REP15Q6BDI9 236 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 FAM13CQ8NE31 585 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 CENPMQ9NSP4 180 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 GRHL1Q9NZI5 618 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 IL36AQ9UHA7 158 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 DEPDC5O75140 1603 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 TMEM88BA6NKF7 163 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 B4GALT5O43286 388 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 PEX14O75381 377 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 SELPP16109 830 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 RGS19P49795 217 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 SCN1BQ07699 218 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 SLC26A9Q7LBE3 791 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 PQLC1Q8N2U9 271 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 TCEAL3Q969E4 200 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 TAS2R7Q9NYW3 318 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 NUP50Q9UKX7 468 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 C8GP07360 202 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 OR4Q2P0C623 313 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 CPN2P22792 545 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 RPL5P46777 297 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 AAGABQ6PD74 315 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 ENPP7Q6UWV6 458 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 VSIG10LQ86VR7 867 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 TMEM168Q9H0V1 697 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 E2F3O00716 465 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 GADD45GO95257 159 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 CAP1Q01518 475 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 NFATC2Q13469 925 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 GPR68Q15743 365 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 NTRK3Q16288 839 aa16.18■□□□□ 0.18
LAMC1-201ENST00000258341 LRRC38Q5VT99 294 aa16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms