RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000037117.5

Gtf3c4-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c4, Length 6,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gm3476K7N6V0 257 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 SgceO70258 437 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 FesP16879 822 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Nr5a2P45448 560 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Fam89aQ14BJ1 175 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gpr156Q6PCP7 798 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Zfp866Q6PGD2 520 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Olfr781Q8VFZ8 311 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Crb1Q8VHS2 1405 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Alg2Q9DBE8 415 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Aldh7a1Q9DBF1 539 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Mst1rQ62190 1378 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Adgra3Q7TT36 1310 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Pramel3A2AHA7 463 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gm7903A2AWL1 463 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Apold1E9Q0X2 246 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gm16494E9Q2Z4 87 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gm6356L7N2A7 188 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Fam71e2L7N480 754 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gpd1P13707 349 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Acvr2aP27038 513 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Klhl42Q8BFQ9 493 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Nipal1Q8BMW7 416 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ipo13Q8K0C1 963 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Polr1eQ8K202 482 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Olfr1276Q8VF40 312 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Cavin3Q91VJ2 260 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Cyp4f15Q99N18 534 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ncbp2Q9CQ49 156 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Rnf128Q9D304 428 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Trpv4Q9EPK8 871 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gm281D3Z1Y0 860 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gm3594E9Q2A7 267 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ptpn6P29351 595 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ruvbl1P60122 456 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 RubcnlQ3TD16 648 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Klhl5Q6PFE1 708 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Thoc7Q7TMY4 204 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Rab39aQ8BHD0 217 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 PigxQ99LV7 254 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Cir1Q9DA19 450 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 TescQ9JKL5 214 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Casz1Q9CWL2 1761 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Vmn2r17E9PYF5 849 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Slc10a3P21129 473 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Mmp3P28862 477 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 GnrhrQ01776 327 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Srebf2Q3U1N2 1130 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Hbs1lQ69ZS7 682 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Zc3h12dQ8BIY3 533 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 CenpxQ8C4X1 78 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Exd1Q8CDF7 570 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 CarfQ8VHI4 689 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Tbc1d15Q9CXF4 671 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 DlstQ9D2G2 454 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Coro7Q9D2V7 922 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Dnase1l1Q9D7J6 314 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Usp12Q9D9M2 370 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Plscr3Q9JIZ9 296 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Tmem59Q9QY73 323 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Clec4eQ9R0Q8 214 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ndor1A2AI05 598 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 NoctO35710 429 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Suv39h1O54864 412 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gstm3P19639 218 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 TktP40142 623 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Fubp3Q3TIX6 575 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 HexdcQ3U4H6 486 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ankrd27Q3UMR0 1048 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Eef2kmtQ3UZW7 335 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Mpzl3Q3V3F6 237 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Q8BHN7 327 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Pnpla8Q8K1N1 776 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Irf2bplQ8K3X4 775 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Olfr705Q9EPF7 316 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 FarsbQ9WUA2 589 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Mettl1Q9Z120 268 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Uba2Q9Z1F9 638 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Itga5P11688 1053 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gria1P23818 907 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 EdnrbP48302 442 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 NadkP58058 439 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Trcg1Q58Y74 825 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Phf8Q80TJ7 1023 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Wdr59Q8C0M0 992 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ndc1Q8VCB1 673 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Olfr1487Q8VFQ6 315 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Itfg1Q99KW9 610 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Rnft1Q9DCN7 395 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Iigp1Q9QZ85 413 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 FaahO08914 579 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Dusp11Q6NXK5 321 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Syt16Q7TN83 639 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Olfr1093Q8VF14 322 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Olfr1100Q8VFM1 321 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Olfr784Q8VFZ9 319 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Olfr539Q8VGL9 319 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Etv5Q9CXC9 510 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Tmed5Q9CXE7 229 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Akr1e2Q9DCT1 301 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.3 ms