Protein–RNA interactions for Protein: P13707

Gpd1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpd1P13707 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Gpd1P13707 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Gpd1P13707 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gpd1P13707 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gpd1P13707 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gpd1P13707 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gpd1P13707 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Gpd1P13707 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Gpd1P13707 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gpd1P13707 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gpd1P13707 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpd1P13707 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gpd1P13707 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gpd1P13707 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Gpd1P13707 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Gpd1P13707 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gpd1P13707 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gpd1P13707 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gpd1P13707 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gpd1P13707 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gpd1P13707 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gpd1P13707 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gpd1P13707 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gpd1P13707 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gpd1P13707 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gpd1P13707 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Gpd1P13707 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gpd1P13707 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gpd1P13707 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gpd1P13707 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gpd1P13707 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gpd1P13707 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Gpd1P13707 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Gpd1P13707 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gpd1P13707 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gpd1P13707 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gpd1P13707 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gpd1P13707 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gpd1P13707 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Gpd1P13707 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gpd1P13707 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gpd1P13707 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gpd1P13707 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Gpd1P13707 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gpd1P13707 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gpd1P13707 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gpd1P13707 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Gpd1P13707 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gpd1P13707 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gpd1P13707 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gpd1P13707 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gpd1P13707 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gpd1P13707 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gpd1P13707 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gpd1P13707 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gpd1P13707 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gpd1P13707 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gpd1P13707 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpd1P13707 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpd1P13707 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gpd1P13707 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gpd1P13707 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpd1P13707 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gpd1P13707 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpd1P13707 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gpd1P13707 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpd1P13707 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpd1P13707 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gpd1P13707 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gpd1P13707 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gpd1P13707 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gpd1P13707 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gpd1P13707 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpd1P13707 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gpd1P13707 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gpd1P13707 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gpd1P13707 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gpd1P13707 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gpd1P13707 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gpd1P13707 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Gpd1P13707 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gpd1P13707 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gpd1P13707 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gpd1P13707 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gpd1P13707 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gpd1P13707 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gpd1P13707 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gpd1P13707 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gpd1P13707 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gpd1P13707 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gpd1P13707 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gpd1P13707 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gpd1P13707 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gpd1P13707 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gpd1P13707 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gpd1P13707 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpd1P13707 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gpd1P13707 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpd1P13707 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpd1P13707 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms