Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Clec4eQ9R0Q8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Clec4eQ9R0Q8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Clec4eQ9R0Q8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Clec4eQ9R0Q8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Clec4eQ9R0Q8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clec4eQ9R0Q8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Clec4eQ9R0Q8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Clec4eQ9R0Q8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clec4eQ9R0Q8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clec4eQ9R0Q8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clec4eQ9R0Q8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clec4eQ9R0Q8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Clec4eQ9R0Q8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Clec4eQ9R0Q8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clec4eQ9R0Q8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Clec4eQ9R0Q8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Clec4eQ9R0Q8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clec4eQ9R0Q8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clec4eQ9R0Q8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clec4eQ9R0Q8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clec4eQ9R0Q8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clec4eQ9R0Q8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clec4eQ9R0Q8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clec4eQ9R0Q8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clec4eQ9R0Q8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clec4eQ9R0Q8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Clec4eQ9R0Q8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Clec4eQ9R0Q8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clec4eQ9R0Q8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clec4eQ9R0Q8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clec4eQ9R0Q8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clec4eQ9R0Q8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clec4eQ9R0Q8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clec4eQ9R0Q8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clec4eQ9R0Q8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clec4eQ9R0Q8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clec4eQ9R0Q8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clec4eQ9R0Q8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clec4eQ9R0Q8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Clec4eQ9R0Q8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clec4eQ9R0Q8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clec4eQ9R0Q8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clec4eQ9R0Q8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clec4eQ9R0Q8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clec4eQ9R0Q8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clec4eQ9R0Q8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clec4eQ9R0Q8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clec4eQ9R0Q8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clec4eQ9R0Q8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clec4eQ9R0Q8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clec4eQ9R0Q8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Clec4eQ9R0Q8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clec4eQ9R0Q8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clec4eQ9R0Q8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clec4eQ9R0Q8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clec4eQ9R0Q8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clec4eQ9R0Q8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clec4eQ9R0Q8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Clec4eQ9R0Q8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clec4eQ9R0Q8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clec4eQ9R0Q8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clec4eQ9R0Q8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clec4eQ9R0Q8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clec4eQ9R0Q8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clec4eQ9R0Q8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clec4eQ9R0Q8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clec4eQ9R0Q8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clec4eQ9R0Q8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clec4eQ9R0Q8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clec4eQ9R0Q8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec4eQ9R0Q8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clec4eQ9R0Q8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clec4eQ9R0Q8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Clec4eQ9R0Q8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Clec4eQ9R0Q8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clec4eQ9R0Q8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clec4eQ9R0Q8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clec4eQ9R0Q8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Clec4eQ9R0Q8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clec4eQ9R0Q8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clec4eQ9R0Q8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Clec4eQ9R0Q8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clec4eQ9R0Q8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clec4eQ9R0Q8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clec4eQ9R0Q8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clec4eQ9R0Q8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clec4eQ9R0Q8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clec4eQ9R0Q8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clec4eQ9R0Q8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clec4eQ9R0Q8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clec4eQ9R0Q8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clec4eQ9R0Q8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clec4eQ9R0Q8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clec4eQ9R0Q8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clec4eQ9R0Q8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clec4eQ9R0Q8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clec4eQ9R0Q8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Clec4eQ9R0Q8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clec4eQ9R0Q8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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