RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 MmadhcQ99LS1 296 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ankrd61Q9CQM6 421 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 P2yr13Q9D8I2 337 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm10718D3Z1I7 227 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr603L7N1Y4 312 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tnfrsf11aO35305 625 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc28a2O88627 660 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cyp4a10O88833 509 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 E330014E10RikQ3UL33 481 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Upf3aQ3ULJ3 422 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 D5Ertd577eQ499F0 481 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Spin1Q61142 262 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prrt3Q6PE13 971 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Btnl1Q7TST0 509 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q8BHN7 327 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 NrrosQ8BMT4 693 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cpsf7Q8BTV2 471 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Exd1Q8CDF7 570 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mark4Q8CIP4 752 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1276Q8VF40 312 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Grip1Q925T6 1127 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pno1Q9CPS7 248 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tma16Q9CR02 221 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gabra4Q9D6F4 552 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 UprtB1AVZ0 310 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Obox6G3X9U1 347 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Arfip1G5E8V9 373 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 DmpkP54265 631 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gal3st3P61315 431 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lrrc74bQ14BP6 391 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc9b2Q5BKR2 547 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr293Q7TS10 336 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SvopQ8BFT9 548 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fam110bQ8C739 366 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PawrQ925B0 333 aa10.78□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn1r2A2AMT6 306 aa10.77□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 BC024978J3QPC3 361 aa10.77□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Znf143O70230 638 aa10.77□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Atxn1lP0C7T6 687 aa10.77□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CntfP51642 198 aa10.77□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 VegfaQ00731 214 aa10.77□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gas1Q01721 343 aa10.77□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Znf865Q3U3I9 1058 aa10.77□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prkg2Q61410 762 aa10.77□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prkd1Q62101 918 aa10.77□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc39a4Q78IQ7 660 aa10.77□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q8BHG2 160 aa10.77□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfm2Q8BM13 448 aa10.77□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gramd1cQ8CI52 457 aa10.77□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ints14Q8R3P6 515 aa10.77□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Capns2Q9D7J7 247 aa10.77□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pou5f2Q9DAC9 329 aa10.77□□□□□ -0.68
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Chrna10B2RX82 447 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn2r116E9Q6I0 856 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ring1O35730 406 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Socs5O54928 536 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Chrna4O70174 629 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Akap3O88987 864 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ccnb2P30276 398 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pbx1P41778 430 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Adamts19P59509 1210 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kcnj13P86046 360 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 RptnP97347 1118 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PhgdhQ61753 533 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sema4aQ62178 760 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr301Q7TS04 311 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fam131aQ8BWU3 361 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lrrc19Q8BZT5 364 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q9CWU4 180 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cdh13Q9WTR5 714 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cldn9Q9Z0S7 217 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Inpp5aE9QAS7 422 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 ZfrO88532 1074 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 MbP04247 154 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pydc3Q3V3Q4 588 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tex13c3Q810P0 219 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tm9sf4Q8BH24 643 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nudt8Q9CR24 210 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ribc2Q9D4Q1 309 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Acot2Q9QYR9 453 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 NsdhlQ9R1J0 362 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ggt5Q9Z2A9 573 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fibcd1A2AV25 459 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mkln1O89050 735 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 RapsnP12672 412 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dsc1P55849 886 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Il18P70380 192 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc10a7Q5PT53 340 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Serpina3fQ80X76 445 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fem1abQ8C0T1 654 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 GsdmcQ99NB5 468 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PpidQ9CR16 370 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rex1bdQ9CYZ6 169 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Spaca7Q9D2S4 182 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PirQ9D711 290 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fem1aaQ9Z2G1 654 aa10.77□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc25a54B1AUS6 473 aa10.76□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 9630041A04RikD3Z3U4 205 aa10.76□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr220E9Q050 325 aa10.76□□□□□ -0.69
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fam71e2L7N480 754 aa10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.3 ms