Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Gabra4Q9D6F4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gabra4Q9D6F4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gabra4Q9D6F4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Gabra4Q9D6F4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gabra4Q9D6F4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gabra4Q9D6F4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Gabra4Q9D6F4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gabra4Q9D6F4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Gabra4Q9D6F4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Gabra4Q9D6F4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gabra4Q9D6F4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gabra4Q9D6F4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gabra4Q9D6F4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Gabra4Q9D6F4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Gabra4Q9D6F4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gabra4Q9D6F4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gabra4Q9D6F4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gabra4Q9D6F4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gabra4Q9D6F4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gabra4Q9D6F4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gabra4Q9D6F4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gabra4Q9D6F4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gabra4Q9D6F4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Gabra4Q9D6F4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gabra4Q9D6F4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gabra4Q9D6F4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gabra4Q9D6F4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gabra4Q9D6F4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gabra4Q9D6F4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gabra4Q9D6F4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gabra4Q9D6F4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Gabra4Q9D6F4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gabra4Q9D6F4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gabra4Q9D6F4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gabra4Q9D6F4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gabra4Q9D6F4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gabra4Q9D6F4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gabra4Q9D6F4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gabra4Q9D6F4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gabra4Q9D6F4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gabra4Q9D6F4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gabra4Q9D6F4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gabra4Q9D6F4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Gabra4Q9D6F4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gabra4Q9D6F4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gabra4Q9D6F4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Gabra4Q9D6F4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gabra4Q9D6F4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gabra4Q9D6F4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gabra4Q9D6F4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gabra4Q9D6F4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gabra4Q9D6F4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gabra4Q9D6F4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gabra4Q9D6F4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gabra4Q9D6F4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gabra4Q9D6F4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gabra4Q9D6F4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gabra4Q9D6F4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gabra4Q9D6F4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gabra4Q9D6F4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gabra4Q9D6F4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gabra4Q9D6F4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gabra4Q9D6F4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gabra4Q9D6F4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Gabra4Q9D6F4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gabra4Q9D6F4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gabra4Q9D6F4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gabra4Q9D6F4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gabra4Q9D6F4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gabra4Q9D6F4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gabra4Q9D6F4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gabra4Q9D6F4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gabra4Q9D6F4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gabra4Q9D6F4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gabra4Q9D6F4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gabra4Q9D6F4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gabra4Q9D6F4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gabra4Q9D6F4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gabra4Q9D6F4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gabra4Q9D6F4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gabra4Q9D6F4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gabra4Q9D6F4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gabra4Q9D6F4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gabra4Q9D6F4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gabra4Q9D6F4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gabra4Q9D6F4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gabra4Q9D6F4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gabra4Q9D6F4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gabra4Q9D6F4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gabra4Q9D6F4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gabra4Q9D6F4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gabra4Q9D6F4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gabra4Q9D6F4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gabra4Q9D6F4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gabra4Q9D6F4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gabra4Q9D6F4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gabra4Q9D6F4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gabra4Q9D6F4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gabra4Q9D6F4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms