RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623316.1

ATRX-210, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-210ENST00000623316 CLEC17AQ6ZS10 378 aa5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 SLFN11Q7Z7L1 901 aa5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 VRK3Q8IV63 474 aa5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 OR4N2Q8NGD1 307 aa5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 P2RX5Q93086 422 aa5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 VPS33AQ96AX1 596 aa5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 CCDC51Q96ER9 411 aa5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 VMP1Q96GC9 406 aa5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 IFT74Q96LB3 600 aa5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 TMEM68Q96MH6 324 aa5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 TIPINQ9BVW5 301 aa5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 C2orf40Q9H1Z8 148 aa5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 C17orf75Q9HAS0 396 aa5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 BPIFA1Q9NP55 256 aa5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 MLXIPLQ9NP71 852 aa5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 TBC1D13Q9NVG8 400 aa5.96□□□□□ -1.46
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ATRX-210ENST00000623316 ODF2LQ9ULJ1 636 aa5.96□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 COL4A3Q01955 1670 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 SLC22A23A1A5C7 686 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 DPPA5A6NC42 116 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ARL5CA6NH57 179 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 A8MXE2 369 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 TARM1B6A8C7 271 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 EBAG9O00559 213 aa5.95□□□□□ -1.46
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ATRX-210ENST00000623316 NEURL1O76050 574 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 TFEBP19484 476 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 CASP1P29466 404 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 NMT1P30419 496 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 SLC11A1P49279 550 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 PPARDQ03181 441 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 DSC1Q08554 894 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ACSM2AQ08AH3 577 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 GRIK3Q13003 919 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 SCARB2Q14108 478 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ATF7IP2Q5U623 682 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ACSM2BQ68CK6 577 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 CES5AQ6NT32 575 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 FBXO42Q6P3S6 717 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 SLC39A4Q6P5W5 647 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 SLC27A1Q6PCB7 646 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 LCTLQ6UWM7 567 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ZNF720Q7Z2F6 126 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 HAUS6Q7Z4H7 955 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 TRIM74Q86UV6 250 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 TRIM73Q86UV7 250 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 SLC39A11Q8N1S5 342 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 CNNM3Q8NE01 707 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 CXorf38Q8TB03 319 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 RITA1Q96K30 269 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 GAD1Q99259 594 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 PAFAH2Q99487 392 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 CDT1Q9H211 546 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 HRH4Q9H3N8 390 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 MMRN2Q9H8L6 949 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 CPNE5Q9HCH3 593 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 CFAP45Q9UL16 551 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 PADI1Q9ULC6 663 aa5.95□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 BRWD1Q9NSI6 2320 aa5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 A0A096LPK6 155 aa5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 A0A1B0GVL5 298 aa5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ANKRD63C9JTQ0 380 aa5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 F8W810 466 aa5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 CLGNO14967 610 aa5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 FAM189A1O60320 539 aa5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ATP2C2O75185 946 aa5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 PIGRP01833 764 aa5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 LCKP06239 509 aa5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 QDPRP09417 244 aa5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 MAKP20794 623 aa5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 CMA1P23946 247 aa5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 PON1P27169 355 aa5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 RYKP34925 604 aa5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ME1P48163 572 aa5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 CLCN5P51795 746 aa5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 YPEL5P62699 121 aa5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 GTF2BQ00403 316 aa5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 PMPCAQ10713 525 aa5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 HYAL1Q12794 435 aa5.94□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
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