RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 DLG1Q12959 904 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ADAM15Q13444 863 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 DPYSL3Q14195 570 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 CDK10Q15131 360 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 NOMO1Q15155 1222 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 RAB6CQ53S08 254 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 XKR4Q5GH76 650 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ANKRD22Q5VYY1 191 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ARHGAP17Q68EM7 881 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 NOTUMQ6P988 496 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 C4orf50Q6ZRC1 276 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 SPATC1Q76KD6 591 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 TRABD2AQ86V40 505 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 HIPK1Q86Z02 1210 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 RFX6Q8HWS3 928 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 FNDC5Q8NAU1 212 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 NANPQ8TBE9 248 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 CCDC74BQ96LY2 380 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 CYTH2Q99418 400 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ECSITQ9BQ95 431 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 TBCDQ9BTW9 1192 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 RAB6CQ9H0N0 254 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 SLC26A1Q9H2B4 701 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 PNPLA8Q9NP80 782 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 RNF24Q9Y225 148 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ZNF487B1APH4 448 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 HAS3O00219 553 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 PIRO00625 290 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 MATN3O15232 486 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 SLC22A2O15244 555 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 EFSO43281 561 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 TLR5O60602 858 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 PDGFAP04085 211 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 PF4V1P10720 104 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 BMP1P13497 986 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 PPP3CCP48454 512 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 RAB4BP61018 213 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 SLC6A3Q01959 620 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 MGAT3Q09327 533 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 PDK2Q15119 407 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 PTPRRQ15256 657 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 SSX2Q16385 188 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 HIF1AQ16665 826 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 SOWAHAQ2M3V2 549 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 C9orf57Q5W0N0 161 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 RAET1GQ6H3X3 334 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 OR6B2Q6IFH4 312 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ARMC6Q6NXE6 501 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ARCQ7LC44 396 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ERMP1Q7Z2K6 904 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 TLK2Q86UE8 772 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 DENND6AQ8IWF6 608 aa7.5□□□□□ -1.21
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HCG18-244ENST00000602516 BEST2Q8NFU1 509 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 LIPHQ8WWY8 451 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 MYRFLQ96LU7 910 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 RNF157Q96PX1 679 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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HCG18-244ENST00000602516 TWSG1Q9GZX9 223 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 DOCK3Q8IZD9 2030 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 PQLC2LA1A4F0 135 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ANGPT2O15123 496 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 HS6ST1O60243 411 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 SNX3O60493 162 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 USP12O75317 370 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 OAZ2O95190 189 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 MBP02144 154 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 LCKP06239 509 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 POU2F2P09086 479 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 CDH1P12830 882 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 TSHRP16473 764 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 ARNTP27540 789 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 CRHR1P34998 444 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 HMGCLP35914 325 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 RAC3P60763 192 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 COPZ1P61923 177 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 DSG1Q02413 1049 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 GAD2Q05329 585 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-244ENST00000602516 MMRN1Q13201 1228 aa7.5□□□□□ -1.21
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