RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587260.1

NFIX-208, Transcript of nuclear factor I X, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NFIX, Length 1,537 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIX-208ENST00000587260 CTSEP14091 401 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 CPA3P15088 417 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 GLRBP48167 497 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 BLKP51451 505 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 CTBSQ01459 385 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 PRRT3Q5FWE3 981 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 XKR5Q6UX68 686 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 SUMF1Q8NBK3 374 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 CKAP2Q8WWK9 683 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 GLMNQ92990 594 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 CAPN10Q9HC96 672 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 MLXIPLQ9NP71 852 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 SIRPGQ9P1W8 387 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 XPR1Q9UBH6 696 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 CACNA1EQ15878 2313 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 CACNA1HO95180 2353 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 H3BM21 787 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 TK2O00142 265 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 SNX2O60749 519 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 VCLP18206 1134 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 ACTR1BP42025 376 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 KCNC1P48547 511 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 ACTR1AP61163 376 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 DMPKQ09013 629 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.076e-8■■■■■ 27.3
NFIX-208ENST00000587260 RPA4Q13156 261 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 OR4D1Q15615 310 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 PDK4Q16654 411 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 SLC23A3Q6PIS1 610 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 ZYG11AQ6WRX3 759 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 RGS9BPQ6ZS82 235 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 RASGRP3Q8IV61 690 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 VRK3Q8IV63 474 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 SLC22A15Q8IZD6 547 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 OR2I1PQ8NGU4 316 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 LMX1AQ8TE12 382 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 TMEM159Q96B96 161 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 SCYL1Q96KG9 808 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 MAGEB18Q96M61 343 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 DPEP2Q9H4A9 486 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 ALG9Q9H6U8 611 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 GMEB2Q9UKD1 530 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 IKZF3Q9UKT9 509 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 SLC6A14Q9UN76 642 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 PSMD13Q9UNM6 376 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 PRR19A6NJB7 356 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 CDC7O00311 574 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 KERAO60938 352 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 MAPK9P45984 424 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 IRX4P78413 519 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 LRP8Q14114 963 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 PCLAFQ15004 111 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 SBSNQ6UWP8 590 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 CCDC63Q8NA47 563 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 OR6Y1Q8NGX8 325 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 IL21RQ9HBE5 538 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 OXSMQ9NWU1 459 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 FRYLO94915 3013 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIX-208ENST00000587260 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NFIX-208ENST00000587260 SYCE1LA8MT33 242 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIX-208ENST00000587260 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIX-208ENST00000587260 GFYI3L273 518 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIX-208ENST00000587260 BTN3A1O00481 513 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIX-208ENST00000587260 KLF11O14901 512 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIX-208ENST00000587260 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NFIX-208ENST00000587260 SLC16A5O15375 505 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIX-208ENST00000587260 DLX3O60479 287 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIX-208ENST00000587260 MATN4O95460 622 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIX-208ENST00000587260 RETP07949 1114 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIX-208ENST00000587260 MYL2P10916 166 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIX-208ENST00000587260 MTHFD2P13995 350 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIX-208ENST00000587260 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NFIX-208ENST00000587260 PDHA2P29803 388 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIX-208ENST00000587260 ALDH3A1P30838 453 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIX-208ENST00000587260 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NFIX-208ENST00000587260 PRKAA2P54646 552 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIX-208ENST00000587260 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
NFIX-208ENST00000587260 TSNQ15631 228 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NFIX-208ENST00000587260 HLA-BQ31612 363 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms