RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569745.5

CCNDBP1-215, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,356 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-215ENST00000569745 MGAT1P26572 445 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 NMBRP28336 390 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 COILP38432 576 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 TTPAP49638 278 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 VPS41P49754 854 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 ACY1Q03154 408 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 ABHD18Q0P651 414 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 PRKG2Q13237 762 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 MAP7Q14244 749 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 CYP1B1Q16678 543 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 OR52E1Q8NGJ3 308 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 ACTRT1Q8TDG2 376 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 COG1Q8WTW3 980 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 EFHD1Q9BUP0 239 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 KIFC1Q9BW19 673 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 TSSK1BQ9BXA7 367 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 ITGB2P05107 769 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 FOLR1P15328 257 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 ZNF28P17035 718 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 ACADLP28330 430 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 MAGEA6P43360 314 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 TERF1P54274 439 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 TUBB3Q13509 450 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 KCNJ11Q14654 390 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 SYTL3Q4VX76 610 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 NAPRTQ6XQN6 538 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 AMIGO1Q86WK6 493 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 D2HGDHQ8N465 521 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 ESX1Q8N693 406 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 MFSD3Q96ES6 412 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 FCRL4Q96PJ5 515 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 CARD6Q9BX69 1037 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 SLC12A9Q9BXP2 914 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 SYBUQ9NX95 663 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 POLG2Q9UHN1 485 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 RARRES3Q9UL19 164 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 ASF1AQ9Y294 204 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 NBEAQ8NFP9 2946 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 GSAPA4D1B5 854 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 BTN3A3O00478 584 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 CES2O00748 559 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 KIAA0754O94854 1291 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 VAPBO95292 243 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 PRB1P04280 392 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 CCR7P32248 378 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 C19orf57Q0VDD7 668 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 KCNAB1Q14722 419 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 TMTC4Q5T4D3 741 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 ARMC3Q5W041 872 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 TBC1D21Q8IYX1 336 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 MPP5Q8N3R9 675 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 HGH1Q9BTY7 390 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 C1GALT1Q9NS00 363 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 FGF21Q9NSA1 209 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 POMT2Q9UKY4 750 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 SNX12Q9UMY4 172 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 SOX13Q9UN79 622 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 NEU2Q9Y3R4 380 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 IQCF5A8MTL0 148 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 BTN3A1O00481 513 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 AVILO75366 819 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 NDUFS3O75489 264 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 EBLN1P0CF75 366 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 MLNP12872 115 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 ITGB6P18564 788 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 CDH3P22223 829 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 CYP4F2P78329 520 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 HSPA14Q0VDF9 509 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 LY6DQ14210 128 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 LINC00303Q3SY05 128 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 CES3Q6UWW8 571 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 UNC5BQ8IZJ1 945 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 OR5AR1Q8NGP9 310 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 ASZ1Q8WWH4 475 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 CPT1BQ92523 772 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 SLC45A3Q96JT2 553 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 PPM1MQ96MI6 270 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 XKR8Q9H6D3 395 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 IGSF10Q6WRI0 2623 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-215ENST00000569745 MAGEB16A2A368 324 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms