RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	AKT1	P31749	480 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	LMAN1	P49257	510 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	ZBED6	P86452	979 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	WASHC5	Q12768	1159 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	H2AFV	Q71UI9	128 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	CUZD1	Q86UP6	607 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	NAT14	Q8WUY8	206 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	LCN9	Q8WX39	176 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	TM9SF4	Q92544	642 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	PKP3	Q9Y446	797 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	GSAP	A4D1B5	854 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169		H3BMH7	237 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	BTN3A1	O00481	513 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	PEX12	O00623	359 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	MAP3K7	O43318	606 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	CBSL	P0DN79	551 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	PRF1	P14222	555 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	PVR	P15151	417 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	NFKB1	P19838	968 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	CBS	P35520	551 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	PBX1	P40424	430 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	FOLR3	P41439	243 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	GLRB	P48167	497 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	KRT33B	Q14525	404 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	PTPRCAP	Q14761	206 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	LLGL1	Q15334	1064 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	SLC1A5	Q15758	541 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	MLIP	Q5VWP3	458 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	DAAM2	Q86T65	1068 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	KCNMB4	Q86W47	210 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	MARVELD3	Q96A59	401 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	FCRL5	Q96RD9	977 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	NRTN	Q99748	197 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	APC	P25054	2843 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	AGAP14	A8MT82	685 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	MASP2	O00187	686 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	E2F3	O00716	465 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	LRRTM2	O43300	516 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	PRAMEF1	O95521	474 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	CD63	P08962	238 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	GABRA4	P48169	554 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	NR2C2	P49116	596 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	PRLHR	P49683	370 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	PER3	P56645	1201 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	MESD	Q14696	234 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	RFX6	Q8HWS3	928 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	GPR135	Q8IZ08	494 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	HM13	Q8TCT9	377 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	PTER	Q96BW5	349 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	GBP5	Q96PP8	586 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	ASB8	Q9H765	288 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	FAM60A	Q9NP50	221 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	CACNA1C	Q13936	2221 aa		11	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		11	□□□□□ -0.65
TCF4-238	ENST00000568169	CCDC66	A2RUB6	948 aa		11	□□□□□ -0.65

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