RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545170.5

ATXN3-216, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 6,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-216ENST00000545170 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 SLC15A3Q8IY34 581 aa8.51□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 OR4Q3Q8NH05 313 aa8.51□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 VPS25Q9BRG1 176 aa8.51□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 COA1Q9GZY4 146 aa8.51□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 OR51V1Q9H2C8 321 aa8.51□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 ERVK-7P63135 1459 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 RTL4Q6ZR62 310 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 OR10H5Q8NGA6 315 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 CASTOR1Q8WTX7 329 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 SLC41A3Q96GZ6 507 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 AGAP2Q99490 1192 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 ARL5AQ9Y689 179 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 SLC12A8A0AV02 714 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 OR6C6A6NF89 314 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF208O43345 1280 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 BUD23O43709 281 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 PNPP00491 289 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 CDC42EP1Q00587 391 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 PDIA6Q15084 440 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 TOMM20Q15388 145 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 POC1BQ8TC44 478 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 FUNDC2Q9BWH2 189 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 BRINP2Q9C0B6 783 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 REEP4Q9H6H4 257 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 NTN4Q9HB63 628 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 LRTM1Q9HBL6 345 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 TIMM22Q9Y584 194 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 HEG1Q9ULI3 1381 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 A0A1W2PRQ8 180 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 CBY3A6NI87 242 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 RAMP2O60895 175 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 OAZ2O95190 189 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 PAHP00439 452 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 OR1E1P30953 314 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 PPM1AP35813 382 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 MAP2K4P45985 399 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 FOXO4P98177 505 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 GRAPQ13588 217 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 NOTUMQ6P988 496 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 DOK6Q6PKX4 331 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 CANT1Q8WVQ1 401 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 MALSU1Q96EH3 234 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 MED30Q96HR3 178 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 MEAF6Q9HAF1 191 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 FBRSQ9HAH7 460 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 SH2B3Q9UQQ2 575 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 A0A1B0GV50 99 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 SLC35F4A4IF30 521 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 ITGA10O75578 1167 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 RFPL3O75679 317 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 PET100P0DJ07 73 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 HOXC8P31273 242 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 OR1G1P47890 313 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 FGFBP1Q14512 234 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 TPGS1Q6ZTW0 290 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 SPATA22Q8NHS9 363 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 ZSWIM3Q96MP5 696 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 TSSK3Q96PN8 268 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 KCNH7Q9NS40 1196 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 CD300AQ9UGN4 299 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 GRIN2AQ12879 1464 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 IGSF1Q8N6C5 1336 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 TTC37Q6PGP7 1564 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 LRRN3E7EW58 273 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 BBOX1O75936 387 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 MAGEA3P43357 314 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 NUDT6P53370 316 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 BMT2Q1RMZ1 405 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 C11orf65Q8NCR3 313 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 C15orf40Q8WUR7 153 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 FCAMRQ8WWV6 532 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 UBE2E3Q969T4 207 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 LRCH3Q96II8 777 aa8.5□□□□□ -1.05
ATXN3-216ENST00000545170 COQ10AQ96MF6 247 aa8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms