RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	LCP2	Q13094	533 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC12A1	Q13621	1099 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	ZBTB6	Q15916	424 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	MEP1B	Q16820	701 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	SGO1	Q5FBB7	561 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	XKR4	Q5GH76	650 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	MPP7	Q5T2T1	576 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	HES5	Q5TA89	166 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	STEAP3	Q658P3	488 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	GPR149	Q86SP6	731 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIM69	Q86WT6	500 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	KDM8	Q8N371	416 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	LZTR1	Q8N653	840 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	UBA3	Q8TBC4	463 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	RAET1E	Q8TD07	263 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	LIPH	Q8WWY8	451 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	OTUB2	Q96DC9	234 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	APOLD1	Q96LR9	279 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF558	Q96NG5	402 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	TM9SF2	Q99805	663 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	AGPAT1	Q99943	283 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	EDEM2	Q9BV94	578 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	BBS2	Q9BXC9	721 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	KLHL1	Q9NR64	748 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	INIP	Q9NRY2	104 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	DNAI1	Q9UI46	699 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	IFT52	Q9Y366	437 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	PTPRJ	Q12913	1337 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A088AWK7	358 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A0B4J293	547 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	PRRG1	O14668	218 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	GCAT	O75600	419 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	PGLS	O95336	258 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	DHFR	P00374	187 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	CRYGC	P07315	174 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	CSF1	P09603	554 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM253	P0C7T8	217 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	CXCL8	P10145	99 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	ETS1	P14921	441 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	SAT1	P21673	171 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	PTAFR	P25105	342 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	GSTM2	P28161	218 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	GRK4	P32298	578 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	HMGCL	P35914	325 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	PTGER3	P43115	390 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	GABRB2	P47870	512 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	SERPINB9	P50453	376 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	CLCN5	P51795	746 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	ACLY	P53396	1101 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	NAGLU	P54802	743 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	AP1S2	P56377	157 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	TUBB4B	P68371	445 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	PPP2R2B	Q00005	443 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	PMP22	Q01453	160 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	CDR2	Q01850	454 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	TNFRSF17	Q02223	184 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	MGAT3	Q09327	533 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	PMS2P11	Q13670	270 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		6.66	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		6.66	□□□□□ -1.34

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