RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478914.1

XRCC6-208, Transcript of X-ray repair cross complementing 6, humanhuman

TSL 2

Gene XRCC6, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC6-208ENST00000478914 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 GSDMDP57764 484 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 RPS15P62841 145 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 RPA4Q13156 261 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 ITIH4Q14624 930 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 GPR19Q15760 415 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 SYTL3Q4VX76 610 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 GAS2L3Q86XJ1 694 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 CCDC89Q8N998 374 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 OR52K1Q8NGK4 314 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 CT55Q8WUE5 264 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 ATG4AQ8WYN0 398 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 CPT1BQ92523 772 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 HGH1Q9BTY7 390 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 MVB12BQ9H7P6 319 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 LHX9Q9NQ69 397 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 KCND1Q9NSA2 647 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 SPTBP11277 2137 aa8.5□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 CCDC88CQ9P219 2028 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 A0A0U1RQJ8 604 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 C2orf74A8MZ97 194 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 LIASO43766 372 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 TIAF1O95411 115 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 NTRK1P04629 796 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 OR56A5P0C7T3 313 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 F8A1P23610 371 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 PREPP48147 710 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 CSRP3P50461 194 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 PRAMEP78395 509 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 SNX1Q13596 522 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 BRD3Q15059 726 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 DBN1Q16643 649 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 CCDC38Q502W7 563 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 AFTPHQ6ULP2 937 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 CERS6Q6ZMG9 384 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 AMIGO1Q86WK6 493 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 CLDN19Q8N6F1 224 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 PHC3Q8NDX5 983 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 OR52E1Q8NGJ3 308 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 ELMO1Q92556 727 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 MR1Q95460 341 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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XRCC6-208ENST00000478914 TSSK1BQ9BXA7 367 aa8.49□□□□□ -1.05
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XRCC6-208ENST00000478914 GPR87Q9BY21 358 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 OR52A5Q9H2C5 316 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 ACTL8Q9H568 366 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 ETNK1Q9HBU6 452 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 SYTL2Q9HCH5 934 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 SERTAD3Q9UJW9 196 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 ANAPC5Q9UJX4 755 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 ANAPC2Q9UJX6 822 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 POMT2Q9UKY4 750 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 BTRCQ9Y297 605 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.49□□□□□ -1.05
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XRCC6-208ENST00000478914 MAST4O15021 2626 aa8.49□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 PCM1Q15154 2024 aa8.48□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 CCDC162PA2VCL2 907 aa8.48□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 MROH6A6NGR9 719 aa8.48□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 OR51F1A6NGY5 319 aa8.48□□□□□ -1.05
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XRCC6-208ENST00000478914 RECKO95980 971 aa8.48□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 PRSS56P0CW18 603 aa8.48□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 CYP2A7P20853 494 aa8.48□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 ADRA1DP25100 572 aa8.48□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 PTPN4P29074 926 aa8.48□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 PDHA2P29803 388 aa8.48□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 FOXN2P32314 431 aa8.48□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 SHMT2P34897 504 aa8.48□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
XRCC6-208ENST00000478914 PRKG2Q13237 762 aa8.48□□□□□ -1.05
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