RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 PAK5Q9P286 719 aa12.67□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa12.67□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 NBASA2RRP1 2371 aa12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 ANKRD12Q6UB98 2062 aa12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 BTN3A3O00478 584 aa12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 SUN1O94901 812 aa12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 CASQ1P31415 396 aa12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 FOXN2P32314 431 aa12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 DLSTP36957 453 aa12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 FNTAP49354 379 aa12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 CRADDP78560 199 aa12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 TUBB3Q13509 450 aa12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 KRT33BQ14525 404 aa12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 CYP1B1Q16678 543 aa12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 LINC00523Q86TU6 105 aa12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 TMEM135Q86UB9 458 aa12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 C19orf43Q9BQ61 176 aa12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 KLHL25Q9H0H3 589 aa12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 CASS4Q9NQ75 786 aa12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 CROTQ9UKG9 612 aa12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 MYO18BQ8IUG5 2567 aa12.66□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 CFAP99D6REC4 459 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 AP3B1O00203 1094 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 TERTO14746 1132 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 GOT2P00505 430 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 APRTP07741 180 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 TPBGLP0DKB5 382 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 PVRP15151 417 aa12.65□□□□□ -0.38
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HPS1-211ENST00000478087 TERF1P54274 439 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 CDH17Q12864 832 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 SEMA5AQ13591 1074 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 SKIDA1Q1XH10 827 aa12.65□□□□□ -0.38
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HPS1-211ENST00000478087 TSTD2Q5T7W7 516 aa12.65□□□□□ -0.38
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HPS1-211ENST00000478087 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 ZNF534Q76KX8 674 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 GSTA5Q7RTV2 222 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 OOSP2Q86WS3 158 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 PPP1R3BQ86XI6 285 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 D2HGDHQ8N465 521 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 ESX1Q8N693 406 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 PRELID2Q8N945 189 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 SLC38A9Q8NBW4 561 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 HEXDCQ8WVB3 486 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 ZFPM2Q8WW38 1151 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 LCN9Q8WX39 176 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 STARD8Q92502 1023 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 UBXN4Q92575 508 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 CHRAC1Q9NRG0 131 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 FGF21Q9NSA1 209 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 STARD5Q9NSY2 213 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa12.65□□□□□ -0.38
HPS1-211ENST00000478087 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 KLHL33A6NCF5 533 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 TLCD2A6NGC4 264 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 IQCF5A8MTL0 148 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 E7EVH7 732 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 CCDC188H7C350 402 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 BTN3A1O00481 513 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 PHF2O75151 1096 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 KATNA1O75449 491 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 GAS8O95995 478 aa12.64□□□□□ -0.39
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HPS1-211ENST00000478087 HSD11B2P80365 405 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 CDC20Q12834 499 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 LAMB3Q13751 1172 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 MAP7Q14244 749 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 ERV3-1Q14264 604 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 COLEC12Q5KU26 742 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 LCN10Q6JVE6 187 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 ARMC6Q6NXE6 501 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 KLHL35Q6PF15 583 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 ACVR1CQ8NER5 493 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 OR52E1Q8NGJ3 308 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 OR5AR1Q8NGP9 310 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 COG1Q8WTW3 980 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 CT55Q8WUE5 264 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 ELMO1Q92556 727 aa12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
HPS1-211ENST00000478087 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa12.64□□□□□ -0.39
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