RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477486.1

RBMS1-211, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RBMS1, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-211ENST00000477486 SLC35B2Q8TB61 432 aa21.4■■□□□ 1.02
RBMS1-211ENST00000477486 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
RBMS1-211ENST00000477486 GPR87Q9BY21 358 aa21.4■■□□□ 1.02
RBMS1-211ENST00000477486 OR52A5Q9H2C5 316 aa21.4■■□□□ 1.02
RBMS1-211ENST00000477486 ACTL8Q9H568 366 aa21.4■■□□□ 1.02
RBMS1-211ENST00000477486 MVB12BQ9H7P6 319 aa21.4■■□□□ 1.02
RBMS1-211ENST00000477486 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
RBMS1-211ENST00000477486 C1GALT1Q9NS00 363 aa21.4■■□□□ 1.02
RBMS1-211ENST00000477486 ANAPC2Q9UJX6 822 aa21.4■■□□□ 1.02
RBMS1-211ENST00000477486 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa21.4■■□□□ 1.02
RBMS1-211ENST00000477486 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa21.4■■□□□ 1.02
RBMS1-211ENST00000477486 TENM4Q6N022 2769 aa21.39■■□□□ 1.02
RBMS1-211ENST00000477486 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa21.39■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa21.39■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 IFNB1P01574 187 aa21.39■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 CD151P48509 253 aa21.39■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 RPA4Q13156 261 aa21.39■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 BRD3Q15059 726 aa21.39■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 DBN1Q16643 649 aa21.39■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC38Q502W7 563 aa21.39■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM135Q86UB9 458 aa21.39■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 OR52K1Q8NGK4 314 aa21.39■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 ATG4AQ8WYN0 398 aa21.39■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 SEC14L1Q92503 715 aa21.39■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.012e-7■■■■■ 62.8
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 CLIP3Q96DZ5 547 aa21.39■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 HES6Q96HZ4 224 aa21.39■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa21.39■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 POMT2Q9UKY4 750 aa21.39■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 GUCA1BQ9UMX6 200 aa21.39■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF148Q9UQR1 794 aa21.39■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 AP2A2O94973 939 aa21.38■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 GSTM1P09488 218 aa21.38■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 PTPN4P29074 926 aa21.38■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 NSG1P42857 185 aa21.38■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 GSTM4Q03013 218 aa21.38■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 AMIGO1Q86WK6 493 aa21.38■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 PIANPQ8IYJ0 282 aa21.38■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 OR52E1Q8NGJ3 308 aa21.38■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 CPT1BQ92523 772 aa21.38■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 ELMO1Q92556 727 aa21.38■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 TTC1Q99614 292 aa21.38■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 HGH1Q9BTY7 390 aa21.38■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 XKR8Q9H6D3 395 aa21.38■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 BTRCQ9Y297 605 aa21.38■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa21.38■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa21.37■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 OR51F1A6NGY5 319 aa21.37■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 C2orf74A8MZ97 194 aa21.37■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 QSOX1O00391 747 aa21.37■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 BTN3A3O00478 584 aa21.37■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 RECKO95980 971 aa21.37■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 FTH1P02794 183 aa21.37■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 RPS18P62269 152 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 CDH17Q12864 832 aa21.37■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 SNX1Q13596 522 aa21.37■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 LAMB3Q13751 1172 aa21.37■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 RUFY1Q96T51 708 aa21.37■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 KLHL25Q9H0H3 589 aa21.37■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 EPN3Q9H201 632 aa21.37■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 ETNK1Q9HBU6 452 aa21.37■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 SERTAD3Q9UJW9 196 aa21.37■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa21.37■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 MROH6A6NGR9 719 aa21.36■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM150CB9EJG8 249 aa21.36■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 BTN3A1O00481 513 aa21.36■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 RFPL1O75677 317 aa21.36■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 CYP2A7P20853 494 aa21.36■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 FDFT1P37268 417 aa21.36■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 CASRP41180 1078 aa21.36■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 GSDMDP57764 484 aa21.36■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 SYTL3Q4VX76 610 aa21.36■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 TEX19Q8NA77 164 aa21.36■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 C1orf54Q8WWF1 131 aa21.36■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 NRTNQ99748 197 aa21.36■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 TSGA10Q9BZW7 698 aa21.36■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 SYTL2Q9HCH5 934 aa21.36■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 TLK1Q9UKI8 766 aa21.36■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 ASF1AQ9Y294 204 aa21.36■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 PRSS21Q9Y6M0 314 aa21.36■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 HEATR9A2RTY3 570 aa21.35■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC162PA2VCL2 907 aa21.35■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 F8W8V4 182 aa21.35■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 LIASO43766 372 aa21.35■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 KRT86O43790 486 aa21.35■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 OR56A5P0C7T3 313 aa21.35■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 ST6GAL1P15907 406 aa21.35■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 CDC25BP30305 580 aa21.35■■□□□ 1.01
RBMS1-211ENST00000477486 GPS2Q13227 327 aa21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms