RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 SRMSQ9H3Y6 488 aa23.33■■□□□ 1.33
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SMKR1-201ENST00000462322 SAMD15Q9P1V8 674 aa23.33■■□□□ 1.33
SMKR1-201ENST00000462322 SLC5A10A0PJK1 596 aa23.32■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 TLCD2A6NGC4 264 aa23.32■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 GOLGA8MH3BSY2 632 aa23.32■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 NDUFS3O75489 264 aa23.32■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 MLNP12872 115 aa23.32■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 NELFEP18615 380 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 ARL4DP49703 201 aa23.32■■□□□ 1.32
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SMKR1-201ENST00000462322 PPP1R7Q15435 360 aa23.32■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa23.32■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 IL22RA1Q8N6P7 574 aa23.32■■□□□ 1.32
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SMKR1-201ENST00000462322 RAD1O60671 282 aa23.31■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 ARNTP27540 789 aa23.31■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 IL11RAQ14626 422 aa23.31■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 ARMC3Q5W041 872 aa23.31■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
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SMKR1-201ENST00000462322 CARD6Q9BX69 1037 aa23.31■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
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SMKR1-201ENST00000462322 SDR42E2A6NKP2 422 aa23.3■■□□□ 1.32
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SMKR1-201ENST00000462322 GOLGA8TH3BQL2 631 aa23.3■■□□□ 1.32
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SMKR1-201ENST00000462322 CCR7P32248 378 aa23.3■■□□□ 1.32
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SMKR1-201ENST00000462322 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 KMT5CQ86Y97 462 aa23.3■■□□□ 1.32
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SMKR1-201ENST00000462322 PPIL6Q8IXY8 311 aa23.29■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 NLGN4XQ8N0W4 816 aa23.29■■□□□ 1.32
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SMKR1-201ENST00000462322 P2RY12Q9H244 342 aa23.29■■□□□ 1.32
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SMKR1-201ENST00000462322 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa23.28■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 TBC1D21Q8IYX1 336 aa23.28■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 SLC22A15Q8IZD6 547 aa23.28■■□□□ 1.32
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SMKR1-201ENST00000462322 NAT8LQ8N9F0 302 aa23.28■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa23.28■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 RNF31Q96EP0 1072 aa23.28■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 PPM1MQ96MI6 270 aa23.28■■□□□ 1.32
SMKR1-201ENST00000462322 PANX3Q96QZ0 392 aa23.28■■□□□ 1.32
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