RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 NMBRP28336 390 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 TERF1P54274 439 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 SEMA3AQ14563 771 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 BRD3Q15059 726 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 MPP5Q8N3R9 675 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 CARD6Q9BX69 1037 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 PDE7BQ9NP56 450 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 SYBUQ9NX95 663 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 SOX13Q9UN79 622 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 MGAQ8IWI9 3026 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 PHF2O75151 1096 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 FGF5P12034 268 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 MLNP12872 115 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 TCP1P17987 556 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
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PTPN4-208ENST00000460289 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 PPP1R3BQ86XI6 285 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 OR52E1Q8NGJ3 308 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 SLC39A7Q92504 469 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 MFSD3Q96ES6 412 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 POLG2Q9UHN1 485 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 ASF1AQ9Y294 204 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 LOC400499M0QZD8 3231 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 MAGEB16A2A368 324 aa22.35■■□□□ 1.17
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PTPN4-208ENST00000460289 NDUFS3O75489 264 aa22.35■■□□□ 1.17
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PTPN4-208ENST00000460289 ACADLP28330 430 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 ACY1Q03154 408 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 MAP7Q14244 749 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 TMTC4Q5T4D3 741 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 MRNIPQ6NTE8 343 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 AMIGO1Q86WK6 493 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 RASGRP3Q8IV61 690 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 TBC1D21Q8IYX1 336 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 ESX1Q8N693 406 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 MCUQ8NE86 351 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 ASZ1Q8WWH4 475 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 CPT1BQ92523 772 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 EFHD1Q9BUP0 239 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 ULBP3Q9BZM4 244 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
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PTPN4-208ENST00000460289 DLGAP3O95886 979 aa22.34■■□□□ 1.17
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PTPN4-208ENST00000460289 ABHD18Q0P651 414 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 PRKG2Q13237 762 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 ANKRD22Q5VYY1 191 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 CASC4Q6P4E1 433 aa22.34■■□□□ 1.17
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PTPN4-208ENST00000460289 HGH1Q9BTY7 390 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 SAMD15Q9P1V8 674 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 RARRES3Q9UL19 164 aa22.34■■□□□ 1.17
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PTPN4-208ENST00000460289 SDR42E2A6NKP2 422 aa22.33■■□□□ 1.17
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PTPN4-208ENST00000460289 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 NAPRTQ6XQN6 538 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.33■■□□□ 1.17
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PTPN4-208ENST00000460289 PANX3Q96QZ0 392 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 TCF12Q99081 682 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPN4-208ENST00000460289 C1GALT1Q9NS00 363 aa22.33■■□□□ 1.17
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