RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	USP7	Q93009	1102 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	EID2B	Q96D98	161 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	RDH12	Q96NR8	316 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC115	Q96NT0	180 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	VPS35	Q96QK1	796 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	RAD9A	Q99638	391 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	TCF25	Q9BQ70	676 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ACTR8	Q9H981	624 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	SUFU	Q9UMX1	484 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ZBBX	A8MT70	800 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758		H0Y858	1186 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	FXYD1	O00168	92 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ARPC2	O15144	300 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	MYO1D	O94832	1006 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ADH1C	P00326	375 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	LDLR	P01130	860 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	RB1	P06400	928 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC2A4	P14672	509 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	TYR	P14679	529 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	HLA-F	P30511	346 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	GSK3B	P49841	420 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	NR1H2	P55055	460 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	DIO3	P55073	304 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	NME5	P56597	212 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	UFM1	P61960	85 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	TUBA4A	P68366	448 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	LIPE	Q05469	1076 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	RALGDS	Q12967	914 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	TLR1	Q15399	786 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	FUT11	Q495W5	492 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758		Q6ZSR9	355 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR26	Q8NDV2	337 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	HM13	Q8TCT9	377 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ARMC5	Q96C12	935 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	REPS1	Q96D71	796 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	SAMD11	Q96NU1	681 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ACOX2	Q99424	681 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	TLR9	Q9NR96	1032 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	KL	Q9UEF7	1012 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF839	A8K0R7	811 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	IQCF5	A8MTL0	148 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	MANBA	O00462	879 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	PPP6C	O00743	305 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	GSTA4	O15217	222 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	CCL16	O15467	120 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	ATG13	O75143	517 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	SEC22B	O75396	215 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	SCEL	O95171	688 aa		11.27	□□□□□ -0.61

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