RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423271.7

USB1-202, Transcript of U6 snRNA biogenesis phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USB1, Length 1,217 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1-202ENST00000423271 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
USB1-202ENST00000423271 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.78□□□□□ -0.04
USB1-202ENST00000423271 SPTBP11277 2137 aa14.78□□□□□ -0.04
USB1-202ENST00000423271 CCDC162PA2VCL2 907 aa14.77□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 SUN1O94901 812 aa14.77□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 TCN2P20062 427 aa14.77□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 NDUFS1P28331 727 aa14.77□□□□□ -0.05
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USB1-202ENST00000423271 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
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USB1-202ENST00000423271 TTC27Q6P3X3 843 aa14.77□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 LINC00523Q86TU6 105 aa14.77□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 KMT5CQ86Y97 462 aa14.77□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 D2HGDHQ8N465 521 aa14.77□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 DNAAF3Q8N9W5 541 aa14.77□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 PHC3Q8NDX5 983 aa14.77□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 ACVR1CQ8NER5 493 aa14.77□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 OR13J1Q8NGT2 312 aa14.77□□□□□ -0.05
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USB1-202ENST00000423271 CATSPER2Q96P56 530 aa14.77□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.77□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 HGH1Q9BTY7 390 aa14.77□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 FAM117AQ9C073 453 aa14.77□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.77□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 FGF21Q9NSA1 209 aa14.77□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 HOMER3Q9NSC5 361 aa14.77□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa14.77□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 SAR1BQ9Y6B6 198 aa14.77□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
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USB1-202ENST00000423271 FDFT1P37268 417 aa14.76□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 CCR10P46092 362 aa14.76□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 LMAN1P49257 510 aa14.76□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 HSD11B2P80365 405 aa14.76□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 ACY1Q03154 408 aa14.76□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 KCNAB2Q13303 367 aa14.76□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 SEMA5AQ13591 1074 aa14.76□□□□□ -0.05
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USB1-202ENST00000423271 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.76□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.76□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.76□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 CCDC89Q8N998 374 aa14.76□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.76□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 CT55Q8WUE5 264 aa14.76□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 LCN9Q8WX39 176 aa14.76□□□□□ -0.05
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USB1-202ENST00000423271 ZNF778Q96MU6 729 aa14.76□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 RUFY1Q96T51 708 aa14.76□□□□□ -0.05
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USB1-202ENST00000423271 SLC25A18Q9H1K4 315 aa14.76□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 ADNPQ9H2P0 1102 aa14.76□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
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USB1-202ENST00000423271 SOHLH2Q9NX45 425 aa14.76□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 POMT2Q9UKY4 750 aa14.76□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.76□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 HEATR9A2RTY3 570 aa14.75□□□□□ -0.05
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USB1-202ENST00000423271 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 E7EVH7 732 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 BTN3A1O00481 513 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 OR1I1O60431 355 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 KATNA1O75449 491 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 AP2A2O94973 939 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 NTRK1P04629 796 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 FURINP09958 794 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 SFTPCP11686 197 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 CDH3P22223 829 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 CASQ1P31415 396 aa14.75□□□□□ -0.05
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USB1-202ENST00000423271 CD151P48509 253 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 TUBB4BP68371 445 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 MC1RQ01726 317 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 PRKAA1Q13131 559 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 RPA4Q13156 261 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 PRKG2Q13237 762 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 DNASE1L3Q13609 305 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 TUBB2AQ13885 445 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 ITIH4Q14624 930 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 BRD3Q15059 726 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 CYP1B1Q16678 543 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 TSTD2Q5T7W7 516 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 PACS1Q6VY07 963 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.75□□□□□ -0.05
USB1-202ENST00000423271 CREG2Q8IUH2 290 aa14.75□□□□□ -0.05
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