RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421051.1

AP000289.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AP000289.1, Length 1,361 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000289.1-201ENST00000421051 ZBTB26Q9HCK0 441 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 CRTAC1Q9NQ79 661 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 MARK1Q9P0L2 795 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 CDH9Q9ULB4 789 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 CDC14AQ9UNH5 594 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 IFT52Q9Y366 437 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 RAP2CQ9Y3L5 183 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 TCAF1Q9Y4C2 921 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 CKAP5Q14008 2032 aa9.46□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 LOC100653049A0A140TA62 436 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 A0A1B0GVM2 712 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 A0A1W2PPW3 197 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 A1L4Q6 167 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 TCAF2A6NFQ2 919 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 AREL1O15033 823 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 GREM1O60565 184 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 PLXNA2O75051 1894 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 KRT34O76011 436 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 CLPXO76031 633 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 SEC14L2O76054 403 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 AGFG2O95081 481 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 VAPBO95292 243 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 ITGB3P05106 788 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 UGT2B4P06133 528 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 APOA4P06727 396 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 KRT19P08727 400 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 AP3M2P53677 418 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 RPS14P62263 151 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 SEMA5AQ13591 1074 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF846Q147U1 533 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 RAB39AQ14964 217 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 SOWAHAQ2M3V2 549 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 SLC36A3Q495N2 470 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 SPATS1Q496A3 300 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 SLX4IPQ5VYV7 408 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 HMBOX1Q6NT76 420 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 C16orf87Q6PH81 154 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 NCEH1Q6PIU2 408 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 TMEM270Q6UE05 265 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 CLEC14AQ86T13 490 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 IGFN1Q86VF2 1251 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 RFX6Q8HWS3 928 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 SLC25A45Q8N413 288 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 OXR1Q8N573 874 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 FAM47BQ8NA70 645 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 PDZD8Q8NEN9 1154 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 MAPK15Q8TD08 544 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 SLCO4A1Q96BD0 722 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 RCN3Q96D15 328 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 PCED1BQ96HM7 432 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 SLC45A3Q96JT2 553 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 ALPK1Q96QP1 1244 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 TCF12Q99081 682 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 CGRRF1Q99675 332 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 NAT9Q9BTE0 207 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 CD300AQ9UGN4 299 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa9.46□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 RNF103O00237 685 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 PLOD2O00469 737 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 TPP1O14773 563 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 AIM2O14862 343 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 LSM1O15116 133 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 FFAR2O15552 330 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 AVILO75366 819 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 ZMPSTE24O75844 475 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 DNAJB5O75953 348 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 TBX18O95935 607 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 CKMT1AP12532 417 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 CCNA2P20248 432 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 PSMA2P25787 234 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 NFKBIAP25963 317 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 HLCSP50747 726 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 ARPC4P59998 168 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 MYL6P60660 151 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 MPP1Q00013 466 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 PEX6Q13608 980 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 PDK2Q15119 407 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 TRIM16LQ309B1 348 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 FGD3Q5JSP0 725 aa9.45□□□□□ -0.9
AP000289.1-201ENST00000421051 MROH9Q5TGP6 573 aa9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms