RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343524.9

ATG4A-201, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4A, Length 1,941 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4A-201ENST00000343524 GGT1P19440 569 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 CPN2P22792 545 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 YWHAQP27348 245 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 KRT20P35900 424 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 ASPAP45381 313 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 ARHGDIAP52565 204 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 CACNB3P54284 484 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 UBXN2AP68543 259 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 TEKQ02763 1124 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 SLAMF1Q13291 335 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 CDO1Q16878 200 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 PYCR3Q53H96 274 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 TECRLQ5HYJ1 363 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 OR6B2Q6IFH4 312 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 SPESP1Q6UW49 350 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 LRRC8DQ7L1W4 858 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 PRSS42Q7Z5A4 293 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 SLC22A15Q8IZD6 547 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 RBFAQ8N0V3 343 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 OR5B17Q8NGF7 314 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 MYDGFQ969H8 173 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 TUBGCP3Q96CW5 907 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 SLC47A1Q96FL8 570 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 GPR78Q96P69 363 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 SPATA9Q9BWV2 254 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 OR51B5Q9H339 312 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 GORASP2Q9H8Y8 452 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 RNF121Q9H920 327 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 SLC39A1Q9NY26 324 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 DPP3Q9NY33 737 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 CYTH4Q9UIA0 394 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 PHF11Q9UIL8 331 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 KLK4Q9Y5K2 254 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 A0A1B0GVM2 712 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 BTN3A3O00478 584 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 DSCR3O14972 297 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 PROM1O43490 865 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 SGTAO43765 313 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 XPNPEP2O43895 674 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 SLC22A5O76082 557 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 MICAL2O94851 1124 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 PGLSO95336 258 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 MT-ND1P03886 318 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 FGF4P08620 206 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 TGFB3P10600 412 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 IFI30P13284 250 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 ITGB5P18084 799 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 PAMP19021 973 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 TNNI3P19429 210 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 MSH3P20585 1137 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 CYP3A5P20815 502 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 IGFBP5P24593 272 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 CD6P30203 668 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 CA5AP35218 305 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 ABCG1P45844 678 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 NFKB2Q00653 900 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 CD83Q01151 205 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 MGAT3Q09327 533 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 MAB21L1Q13394 359 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 RIN1Q13671 783 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 GNA13Q14344 377 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 TSC22D1Q15714 1073 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 TKFCQ3LXA3 575 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 CES3Q6UWW8 571 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 UTS2BQ765I0 119 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 ZMIZ2Q8NF64 920 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 OR52K1Q8NGK4 314 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 CNIH3Q8TBE1 160 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 DNAJB14Q8TBM8 379 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 CHURC1Q8WUH1 139 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 ASB15Q8WXK1 588 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 TBC1D20Q96BZ9 403 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 WDFY2Q96P53 400 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 CSPG4P5Q96PW8 444 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 WASH6PQ9NQA3 447 aa7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
ATG4A-201ENST00000343524 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms