RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340160.7

TSPAN18-201, Transcript of tetraspanin 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene TSPAN18, Length 4,229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18-201ENST00000340160 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 IL17RCQ8NAC3 791 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 COX4I2Q96KJ9 171 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 GUCD1Q96NT3 240 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 OR2M4Q96R27 311 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 RANBP9Q96S59 729 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 MRGBPQ9NV56 204 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 GSAPA4D1B5 854 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 CDK4P11802 303 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 PRKAA2P54646 552 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 AQP4P55087 323 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 ZP2Q05996 745 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 SFT2D3Q587I9 215 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 FAM217AQ8IXS0 508 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 PQLC1Q8N2U9 271 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 DDHD1Q8NEL9 900 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 OR10G6Q8NH81 332 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 ARRDC2Q8TBH0 407 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 SLC44A1Q8WWI5 657 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 GAB3Q8WWW8 586 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 EDAQ92838 391 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 GPR21Q99679 349 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 CCM2Q9BSQ5 444 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 ARMCX1Q9P291 453 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 SLC17A7Q9P2U7 560 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 OPTCQ9UBM4 332 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.5□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 ANHXE9PGG2 379 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 SCAMP1O15126 338 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 PGM3O95394 542 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 TFEBP19484 476 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 RGRP47804 291 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 CDK9P50750 372 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 RPS14P62263 151 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 NADK2Q4G0N4 442 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 PAGE2BQ5JRK9 111 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 LIPIQ6XZB0 460 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 TMEFF1Q8IYR6 380 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 FBXW8Q8N3Y1 598 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 FBXL6Q8N531 539 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 DCAKDQ8WVC6 231 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 BORCS5Q969J3 196 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 UBE2E3Q969T4 207 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 RSPRY1Q96DX4 576 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 C12orf66Q96MD2 445 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 OCEL1Q9H607 264 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 RMI1Q9H9A7 625 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 KCTD3Q9Y597 815 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 MTX2O75431 263 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 CCNDBP1O95273 360 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 JUNDP17535 347 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 GRK2P25098 689 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 TUBA4AP68366 448 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 NFATC2Q13469 925 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 TMTC4Q5T4D3 741 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 FSTL4Q6MZW2 842 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 KDELC1Q6UW63 502 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 KNL1Q8NG31 2342 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 LCN9Q8WX39 176 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 CCT7Q99832 543 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 TRIM39Q9HCM9 518 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 RIC8BQ9NVN3 520 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 ITM2BQ9Y287 266 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 KCNE2Q9Y6J6 123 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 OR51F1A6NGY5 319 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 OR5K4A6NMS3 321 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 E7ESA3 106 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 TPP1O14773 563 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 VILLO15195 856 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 ZMPSTE24O75844 475 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 EFEMP2O95967 443 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 KRT6AP02538 564 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 KRT6BP04259 564 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 CD38P28907 300 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 P2RY2P41231 377 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 KRT6CP48668 564 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 FNTBP49356 437 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 NAA20P61599 178 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 ZXDAP98168 799 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 MPP1Q00013 466 aa9.49□□□□□ -0.89
TSPAN18-201ENST00000340160 CHI3L2Q15782 390 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms