RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 INPP5DQ92835 1189 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 FERD3LQ96RJ6 166 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 RBBP8Q99708 897 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 MCMBPQ9BTE3 642 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 FUT8Q9BYC5 575 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 SLC40A1Q9NP59 571 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 ASF1AQ9Y294 204 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 DHRS7Q9Y394 339 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 ACADLP28330 430 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 OR1D5P58170 312 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 ABRQ12979 859 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 ACSBG2Q5FVE4 666 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 GRTP1Q5TC63 336 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 ACVR1CQ8NER5 493 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 OLFM1Q99784 485 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 PTPRBP23467 1997 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 CASC3O15234 703 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 FDXRP22570 491 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 SPRP35270 261 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 GPR3P46089 330 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 PGGT1BP53609 377 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 GPR18Q14330 331 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 KLHL38Q2WGJ6 581 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 DHRS13Q6UX07 377 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM26Q6ZUK4 368 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 SPRED1Q7Z699 444 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 CPNE9Q8IYJ1 553 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 KCNK4Q9NYG8 393 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 KLHL42Q9P2K6 505 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 ZW10O43264 779 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 ABHD2P08910 425 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 NDUFS1P28331 727 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 LIMK2P53671 638 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 SLC12A2P55011 1212 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 E2F1Q01094 437 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 SLC29A2Q14542 456 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 GBX1Q14549 363 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 NR1D2Q14995 579 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 PLCL1Q15111 1095 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 AMZ1Q400G9 498 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 OR5AR1Q8NGP9 310 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 SLC39A10Q9ULF5 831 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 IKBKGQ9Y6K9 419 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 B4GAT1O43505 415 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 MAPK9P45984 424 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 TAS2R39P59534 338 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 CCL7P80098 99 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 PRKG2Q13237 762 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 PAQR3Q6TCH7 311 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 HGH1Q9BTY7 390 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 MVB12BQ9H7P6 319 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 OPA1O60313 960 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 DKK1O94907 266 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 INHBAP08476 426 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 CDK4P11802 303 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 CD9P21926 228 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 ATP5DP30049 168 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 USP10Q14694 798 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 NKAIN2Q5VXU1 208 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 FOPNLQ96NB1 174 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 PAFAH2Q99487 392 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 GPR22Q99680 433 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 ZMYND15Q9H091 742 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 EPB41L4BQ9H329 900 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 LRRN3Q9H3W5 708 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 CAB39LQ9H9S4 337 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 UCK1Q9HA47 277 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 SLC24A2Q9UI40 661 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 NFS1Q9Y697 457 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1W2PQM1 296 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 LILRA5A6NI73 299 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 ITGA2BP08514 1039 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 CBSLP0DN79 551 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 CBSP35520 551 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 RGS4P49798 205 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 POU4F1Q01851 419 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF460Q14592 562 aa21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms