RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268717.9

COPS3-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS3, Length 1,641 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3-201ENST00000268717 NELL1Q92832 810 aa15.05■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 ERLEC1Q96DZ1 483 aa15.05■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 CMTM5Q96DZ9 223 aa15.05■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 BTBD10Q9BSF8 475 aa15.05■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 C1orf21Q9H246 121 aa15.05■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 PFDN4Q9NQP4 134 aa15.05■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa15.05■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa15.05■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 CKAP5Q14008 2032 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 LRRC14BA6NHZ5 514 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 GFYI3L273 518 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 GIPC1O14908 333 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 VPS4BO75351 444 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 JUNP05412 331 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 ANXA5P08758 320 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 TIE1P35590 1138 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 GGT5P36269 586 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 WASP42768 502 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 CXCL12P48061 93 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 AGTR2P50052 363 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 HNMTP50135 292 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 AP1S2P56377 157 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 RPS14P62263 151 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 C2orf27AQ580R0 203 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 RAET1GQ6H3X3 334 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 PELI3Q8N2H9 469 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 DLG3Q92796 817 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 RHBDF1Q96CC6 855 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 C19orf60Q96EN9 201 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 CCM2Q9BSQ5 444 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 HGH1Q9BTY7 390 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 TRIM54Q9BYV2 358 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 PARVBQ9HBI1 364 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 ZBTB26Q9HCK0 441 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 TRIM39Q9HCM9 518 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 C2orf42Q9NWW7 574 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 GPR34Q9UPC5 381 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 COQ6Q9Y2Z9 468 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa15.04■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 MTX2O75431 263 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 RASSF9O75901 435 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 TM7SF2O76062 418 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 UROSP10746 265 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 CYP2A7P20853 494 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 TAS2R38P59533 333 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 HSPA14Q0VDF9 509 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 HERC3Q15034 1050 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 PHKG1Q16816 387 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 TMPRSS6Q8IU80 811 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 IL17RCQ8NAC3 791 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 COX14Q96I36 57 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 CD244Q9BZW8 370 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 SLC40A1Q9NP59 571 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 R4GN57 208 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 SLC5A10A0PJK1 596 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 TAPBPO15533 448 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 MATN4O95460 622 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 CHEK2O96017 543 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 OTCP00480 354 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 ENO1P06733 434 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 ATP4BP51164 291 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 CTSCP53634 463 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 SEC13P55735 322 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 KCNJ2P63252 427 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 KLF10Q13118 480 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 GTF2H3Q13889 308 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 NAA25Q14CX7 972 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 RNF165Q6ZSG1 346 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 HDDC3Q8N4P3 179 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 TEX9Q8N6V9 391 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 ZBTB44Q8NCP5 570 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 TWIST2Q8WVJ9 160 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 TMEM159Q96B96 161 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 EGFL8Q99944 293 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 CD248Q9HCU0 757 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 ZSCAN32Q9NX65 697 aa15.03■□□□□ -0
COPS3-201ENST00000268717 WWOXQ9NZC7 414 aa15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms