RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251630.10

PDGFRL-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PDGFRL, Length 1,901 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRL-201ENST00000251630 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 CHPFQ8IZ52 775 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 METTL6Q8TCB7 284 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 RAB7BQ96AH8 199 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 NTMT1Q9BV86 223 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 LMCD1Q9NZU5 365 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 SERGEFQ9UGK8 458 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 LRRK1Q38SD2 2015 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 GIPC1O14908 333 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 ATG13O75143 517 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 KATNA1O75449 491 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 KRT36O76013 467 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 CHEK2O96017 543 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 PREPP48147 710 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 LRP8Q14114 963 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 CST6Q15828 149 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 RAET1GQ6H3X3 334 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 MILR1Q7Z6M3 343 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 HPS6Q86YV9 775 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 ZNF547Q8IVP9 402 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 PGAM4Q8N0Y7 254 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 SFRP1Q8N474 314 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 PLA2G15Q8NCC3 412 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 FOXJ1Q92949 421 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 GLMNQ92990 594 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 SLC45A3Q96JT2 553 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 CCT7Q99832 543 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 EFCAB1Q9HAE3 211 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 SLC52A3Q9NQ40 469 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 ARHGEF33A8MVX0 844 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 GSTM1P09488 218 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 TNFRSF4P43489 277 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 GPR1P46091 355 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 CCNG1P51959 295 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 GSTM4Q03013 218 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 C6orf136Q5SQH8 315 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 FAM46CQ5VWP2 391 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 NEK5Q6P3R8 708 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 TTC23LQ6PF05 361 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 C16orf89Q6UX73 402 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 MTSS1LQ765P7 747 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 CACUL1Q86Y37 369 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 HBEGFQ99075 208 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 SLC32A1Q9H598 525 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 AIG1Q9NVV5 245 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 ATXN10Q9UBB4 475 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 FAM8A1Q9UBU6 413 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 RNF11Q9Y3C5 154 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 H0Y3Z8 333 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 AP1G1O43747 822 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 PSMG1O95456 288 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 EPB42P16452 691 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 GNAZP19086 355 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 PDHA2P29803 388 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 AP1S2P56377 157 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 NME5P56597 212 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 ADGRE1Q14246 886 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 MAPRE2Q15555 327 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 GSTA3Q16772 222 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 PIGGQ5H8A4 983 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 REP15Q6BDI9 236 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 KIAA1211LQ6NV74 962 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 RETREG3Q86VR2 466 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 SLC22A15Q8IZD6 547 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 MIER2Q8N344 545 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 TCAIMQ8N3R3 496 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 CXorf40AQ8TE69 158 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 ATP6V1E2Q96A05 226 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 COX14Q96I36 57 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 TEX37Q96LM6 180 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 BRINP2Q9C0B6 783 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRL-201ENST00000251630 OR2AG1Q9H205 316 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms