RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SnrpaQ62189 287 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nemp1Q6ZQE4 437 aa21.39■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Otop1Q80VM9 600 aa21.39■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ubp1Q811S7 540 aa21.39■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TtpaQ8BWP5 278 aa21.39■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem120aQ8C1E7 343 aa21.39■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rassf4Q8CB96 322 aa21.39■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TwnkQ8CIW5 685 aa21.39■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gtf2h3Q8VD76 309 aa21.39■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Elf5Q8VDK3 253 aa21.39■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Foxp3Q99JB6 429 aa21.39■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tcam1Q99NB3 548 aa21.39■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1700086D15RikQ9D9E9 151 aa21.39■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zswim2Q9D9X6 631 aa21.39■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc29a1Q9JIM1 460 aa21.39■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc5a3Q9JKZ2 718 aa21.39■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Jag2Q9QYE5 1247 aa21.39■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem8bB1AWJ5 472 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 5830473C10RikF8VQ07 620 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr319L7MTY4 306 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ncf2O70145 525 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Avpr2O88721 371 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CblP22682 913 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Csf2rbP26955 896 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 HnrnpkP61979 463 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 F8a1Q00558 380 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc17a7Q3TXX4 560 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 VwceQ3U515 929 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 VclQ64727 1066 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 KdsrQ6GV12 332 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Elmo1Q8BPU7 727 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lats1Q8BYR2 1129 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam221aQ8C790 301 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Scamp1Q8K021 338 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zc3h10Q8R205 435 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pih1d1Q9CQJ2 290 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Snx2Q9CWK8 519 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc70Q9D9B0 223 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc12a4Q9JIS8 1085 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tlr4Q9QUK6 835 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cst9Q9Z0H6 137 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 GghQ9Z0L8 317 aa21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Usp24B1AY13 2617 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm3373A6NAS7 205 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm4969D3YZT1 566 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arl9F7BE40 171 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 KitP05532 979 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ntrk2P15209 821 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tgfb3P17125 410 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 HmbsP22907 361 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CiartQ3TQ03 375 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ntrk1Q3UFB7 799 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prss38Q3UKY7 322 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adam9Q61072 845 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 ManealQ6P1J0 452 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Svs1Q6WIZ7 820 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smpd4Q6ZPR5 823 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ints7Q7TQK1 966 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tyw1Q8BJM7 721 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc184Q8BMK5 191 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 B430218F22RikQ8BQR5 223 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pcdhb7Q8CDY9 829 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AadacQ99PG0 398 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SarnpQ9D1J3 210 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mau2Q9D2X5 619 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc25a27Q9D6D0 322 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tex9Q9D845 387 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rsph9Q9D9V4 276 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmprss6Q9DBI0 811 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Psmg2Q9EST4 264 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Acsl4Q9QUJ7 711 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Il17bQ9QXT6 180 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PygmQ9WUB3 842 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfhx4Q9JJN2 3550 aa21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Serpinb3cA2RSF9 386 aa21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn2r22E9Q7S8 853 aa21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 P01740 135 aa21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 H2-Q7P14429 334 aa21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 H2-Q9P14431 200 aa21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mmp7Q10738 264 aa21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Muc19Q6JHY2 733 aa21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf410Q8BKX7 478 aa21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SntnQ8C9X1 147 aa21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Usp45Q8K387 813 aa21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc6a20aQ8VDB9 592 aa21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Glod4Q9CPV4 298 aa21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 RpainQ9CWY9 219 aa21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 RtcAQ9D7H3 366 aa21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Calr3Q9D9Q6 380 aa21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ddi1Q9DAF3 408 aa21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Amdhd1Q9DBA8 426 aa21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hes6Q9JHE6 224 aa21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MefvQ9JJ26 767 aa21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ncor2Q9WU42 2472 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sptbn4E9PX29 2561 aa21.36■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tcrg-V3A0A0G2JEW2 117 aa21.35■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zscan4eA0A1B0GRE8 505 aa21.35■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc9a3G3X939 829 aa21.35■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AgxtO35423 414 aa21.35■■□□□ 1.01
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tead1P30051 426 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.8 ms