RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622107.4

LTBP4-237, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene LTBP4, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-237ENST00000622107 ERVH48-1M5A8F1 160 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 KDM1AO60341 852 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 NMBRP28336 390 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 SLC19A1P41440 591 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 RPA4Q13156 261 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 TMED2Q15363 201 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 RPE65Q16518 533 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 IZUMO3Q5VZ72 239 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 HOOK3Q86VS8 718 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 FAM129CQ86XR2 697 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 PIANPQ8IYJ0 282 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 BBOF1Q8ND07 529 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 ELMO1Q92556 727 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 ZNF778Q96MU6 729 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 SERPINB12Q96P63 405 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 PANX3Q96QZ0 392 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 COG4Q9H9E3 785 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 PDP2Q9P2J9 529 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 GNPTGQ9UJJ9 305 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 TK2O00142 265 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 KPNA5O15131 536 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 TMEM63AO94886 807 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 UBXN7O94888 489 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 VAPBO95292 243 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 PRSS56P0CW18 603 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 CLCA4Q14CN2 919 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 TGIF1Q15583 401 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 ANKRD22Q5VYY1 191 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 LRRC6Q86X45 466 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 ZFAND4Q86XD8 727 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 CALML6Q8TD86 181 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 ZFPM2Q8WW38 1151 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 SLC39A7Q92504 469 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 TAAR9Q96RI9 348 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 TREX1Q9NSU2 369 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 NEU2Q9Y3R4 380 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 EFCAB7A8K855 629 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 B4E171 279 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 STMND1H3BQB6 276 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 AVILO75366 819 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 TUBB4AP04350 444 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 APOA4P06727 396 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 BRAFP15056 766 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 TSPAN7P41732 249 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 CD151P48509 253 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 RAB15P59190 212 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 PRKAA1Q13131 559 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 MORF4L2Q15014 288 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 MANEAQ5SRI9 462 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 ZNF534Q76KX8 674 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 PDIK1LQ8N165 341 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 NAT8LQ8N9F0 302 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 ART4Q93070 314 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 MFSD3Q96ES6 412 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 ZDHHC12Q96GR4 267 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 SNF8Q96H20 258 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 TCF12Q99081 682 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 NAT9Q9BTE0 207 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 DDA1Q9BW61 102 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 CCDC68Q9H2F9 335 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 SLC39A1Q9NY26 324 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 WDR37Q9Y2I8 494 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-237ENST00000622107 BAHCC1Q9P281 2608 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms