RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916	GATA6	Q92908	595 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PHF21B	Q96EK2	531 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	HIC2	Q96JB3	615 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PANX3	Q96QZ0	392 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	DRC3	Q9H069	523 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	NPHS2	Q9NP85	383 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PNPO	Q9NVS9	261 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	EBF1	Q9UH73	591 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	HAO1	Q9UJM8	370 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	FZD4	Q9ULV1	537 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	RNF112	Q9ULX5	631 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916		A0A1W2PQU0	124 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ERICH4	A6NGS2	130 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	BTN3A1	O00481	513 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	RAD51B	O15315	384 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	NUAK1	O60285	661 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	SLCO2B1	O94956	709 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	IGLV3-19	P01714	112 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PCCB	P05166	539 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF806	P0C7X5	589 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	TPBGL	P0DKB5	382 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	CBSL	P0DN79	551 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	IMPDH1	P20839	514 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ACSL1	P33121	698 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	CBS	P35520	551 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	IGFALS	P35858	605 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	TRIM23	P36406	574 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	RGS4	P49798	205 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	TPMT	P51580	245 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PPP2CB	P62714	309 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PPP2CA	P67775	309 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	CDK3	Q00526	305 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PHKG1	Q16816	387 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	BCL7A	Q4VC05	210 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	STPG1	Q5TH74	334 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	NEK5	Q6P3R8	708 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	SYT13	Q7L8C5	426 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	MAVS	Q7Z434	540 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	FAM124A	Q86V42	546 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	KBTBD6	Q86V97	674 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	LONP2	Q86WA8	852 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	GPSM1	Q86YR5	675 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	GANC	Q8TET4	914 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ASB12	Q8WXK4	309 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	EXT2	Q93063	718 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	CCDC126	Q96EE4	140 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	LOXL4	Q96JB6	756 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	LGR4	Q9BXB1	951 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	TEX101	Q9BY14	249 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		7.19	□□□□□ -1.26

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