RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 CDC23Q9UJX2 597 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 IGF2RP11717 2491 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 URI1O94763 535 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 TTC4O95801 387 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 ITGB6P18564 788 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 PDHA2P29803 388 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.023e-7■■■□□ 17.7
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PTPRK-222ENST00000532751 C16orf72Q14CZ0 275 aa21.43■■□□□ 1.02
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PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D25Q3MII6 688 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 SNAP47Q5SQN1 464 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 PDZD3Q86UT5 571 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 RCBTB1Q8NDN9 531 aa21.43■■□□□ 1.02
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PTPRK-222ENST00000532751 P2RY12Q9H244 342 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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PTPRK-222ENST00000532751 TNFSF15O95150 251 aa21.42■■□□□ 1.02
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PTPRK-222ENST00000532751 ITGA2BP08514 1039 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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PTPRK-222ENST00000532751 ZNF470Q6ECI4 717 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 CILP2Q8IUL8 1156 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 AGBL5Q8NDL9 886 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 ASZ1Q8WWH4 475 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 FGF11Q92914 225 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 ERP44Q9BS26 406 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 MVB12BQ9H7P6 319 aa21.42■■□□□ 1.02
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PTPRK-222ENST00000532751 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 OGFRQ9NZT2 677 aa21.42■■□□□ 1.02
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PTPRK-222ENST00000532751 SPANXN3Q5MJ09 141 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 NAPRTQ6XQN6 538 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 KRT222Q8N1A0 295 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 ACVR1CQ8NER5 493 aa21.41■■□□□ 1.02
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PTPRK-222ENST00000532751 ASCL3Q9NQ33 180 aa21.41■■□□□ 1.02
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PTPRK-222ENST00000532751 TAF4O00268 1085 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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PTPRK-222ENST00000532751 ESR1P03372 595 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 FMO4P31512 558 aa21.4■■□□□ 1.02
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PTPRK-222ENST00000532751 MSS51Q4VC12 460 aa21.4■■□□□ 1.02
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PTPRK-222ENST00000532751 OOSP2Q86WS3 158 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 GSDMBQ8TAX9 411 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 TGM7Q96PF1 710 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 RAB33BQ9H082 229 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 RAB17Q9H0T7 212 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 WHRNQ9P202 907 aa21.4■■□□□ 1.02
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