RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D17Q9HA65 648 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 UBTD1Q9HAC8 227 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 POMT1Q9Y6A1 747 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0G2JPF8 293 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 CLDN4O14493 209 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 VDRP11473 427 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF12P17014 697 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ATP5DP30049 168 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 PRKCZQ05513 592 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 TROAPQ12815 778 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 C6orf136Q5SQH8 315 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 KLC3Q6P597 504 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ASB18Q6ZVZ8 466 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 KMT5CQ86Y97 462 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ZFAND2BQ8WV99 257 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 SPSB1Q96BD6 273 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 MIOSQ9NXC5 875 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087WV48 116 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 GM2AP17900 193 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 PSMA3P25788 255 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 CDC25CP30307 473 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 CCKBRP32239 447 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 BRWD1-AS2P59051 145 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ISL1P61371 349 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 SLC20A2Q08357 652 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 GFRALQ6UXV0 394 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM219Q86XT9 240 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 GDAP1Q8TB36 358 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 FIG4Q92562 907 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 BTBD10Q9BSF8 475 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 IL25Q9H293 177 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 KCNS2Q9ULS6 477 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 OR2W1Q9Y3N9 320 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PPQ1 181 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 HTR3EA5X5Y0 456 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM221A6NGB7 291 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 PSMD14O00487 310 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 PTGESO14684 152 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 WDR1O75083 606 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 H1F0P07305 194 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 PDGFRAP16234 1089 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 PSMC4P43686 418 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ASPRV1Q53RT3 343 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 SFMBT2Q5VUG0 894 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 OR7E24Q6IFN5 339 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 PRR27Q6MZM9 219 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 MOXD1Q6UVY6 613 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 MFSD6Q6ZSS7 791 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 SFR1Q86XK3 245 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRG7Q96K78 797 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC114Q96M63 670 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 FEVQ99581 238 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 FKRPQ9H9S5 495 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 POU2F3Q9UKI9 436 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 PADI2Q9Y2J8 665 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 OR6C76A6NM76 312 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 STX6O43752 255 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 LDB3O75112 727 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 WISP2O76076 250 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 TGDSO95455 350 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 BMP15O95972 392 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 CSF2RAP15509 400 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 CASTP20810 708 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 AHRP35869 848 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 IL15P40933 162 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 RUNX1T1Q06455 604 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 MPP7Q5T2T1 576 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 CREB3L2Q70SY1 520 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA19Q7Z5L4 167 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF575Q86XF7 245 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 IQCA1Q86XH1 822 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 PTOV1Q86YD1 416 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF611Q8N823 705 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 SMRP1Q8NCR6 262 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 KCNE4Q8WWG9 221 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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