RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 PTK6Q13882 451 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 BROXQ5VW32 411 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 MRNIPQ6NTE8 343 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 IRGCQ6NXR0 463 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 XKR5Q6UX68 686 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 KLHL7Q8IXQ5 586 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 NAT8LQ8N9F0 302 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 USP7Q93009 1102 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 C9orf72Q96LT7 481 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 SERPINB12Q96P63 405 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 TGM7Q96PF1 710 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 TAAR9Q96RI9 348 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 RAB33BQ9H082 229 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 EPHA6Q9UF33 1036 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa14.4□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 EFCAB7A8K855 629 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 B4E171 279 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 PRAMEF10O60809 474 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 RASSF9O75901 435 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 CD82P27701 267 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 TSPAN7P41732 249 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 PREPP48147 710 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 RAB15P59190 212 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 SEMA3AQ14563 771 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 C19orf48Q6RUI8 117 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 CES3Q6UWW8 571 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 PDZD3Q86UT5 571 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 OOSP2Q86WS3 158 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRC6Q86X45 466 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ACVR1CQ8NER5 493 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 CARD6Q9BX69 1037 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 MVB12BQ9H7P6 319 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC39A1Q9NY26 324 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC24A2Q9UI40 661 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 GNPTGQ9UJJ9 305 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ACSL6Q9UKU0 697 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 KLK10O43240 276 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ITPKBP27987 946 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 PDHA2P29803 388 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 CASQ1P31415 396 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 MAGEA3P43357 314 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 UCNP55089 124 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 DR1Q01658 176 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 BRD3Q15059 726 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 TMED2Q15363 201 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 COL28A1Q2UY09 1125 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 DCAF12Q5T6F0 453 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 PRSS42Q7Z5A4 293 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 HOOK3Q86VS8 718 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ART4Q93070 314 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 PANX3Q96QZ0 392 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 TCF12Q99081 682 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 DDA1Q9BW61 102 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 OCIAD1Q9NX40 245 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC5A10A0PJK1 596 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 OR5K3A6NET4 321 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 C9orf172C9J069 976 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 KPNA5O15131 536 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 APOA4P06727 396 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ITGB6P18564 788 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ARNTP27540 789 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 PTGIRP43119 386 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 MC2RQ01718 297 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 TLE3Q04726 772 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 PRKAA1Q13131 559 aa14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms