RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.2□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0G2JNG1 304 aa9.18□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 FOXO6A8MYZ6 492 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 PATE3B3GLJ2 98 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 KIR2DS3K7RE56 304 aa9.18□□□□□ -0.94
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