RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 OPTCQ9UBM4 332 aa20.12■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 GMNNO75496 209 aa20.11■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 KCNH1O95259 989 aa20.11■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 INHAP05111 366 aa20.11■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 DGKAP23743 735 aa20.11■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 HMGCS1Q01581 520 aa20.11■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 BCL2L1Q07817 233 aa20.11■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 SGO1Q5FBB7 561 aa20.11■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 APCDD1Q8J025 514 aa20.11■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB18Q99592 522 aa20.11■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.11■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 VAPAQ9P0L0 249 aa20.11■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 KLQ9UEF7 1012 aa20.11■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 CRLS1Q9UJA2 301 aa20.11■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 STOML2Q9UJZ1 356 aa20.11■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
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IMP4-208ENST00000460766 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
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IMP4-208ENST00000460766 DFNA5O60443 496 aa20.1■□□□□ 0.81
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IMP4-208ENST00000460766 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 HOXD10P28358 340 aa20.1■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 ZBED5Q49AG3 693 aa20.1■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 RIMKLAQ8IXN7 391 aa20.1■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 DCAF4L2Q8NA75 395 aa20.1■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 SLC13A3Q8WWT9 602 aa20.1■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 FIG4Q92562 907 aa20.1■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 LATS2Q9NRM7 1088 aa20.1■□□□□ 0.81
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IMP4-208ENST00000460766 ZNF639Q9UID6 485 aa20.1■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 CCL27Q9Y4X3 112 aa20.1■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 PRRG1O14668 218 aa20.1■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 ABLIM3O94929 683 aa20.1■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 ACRV1P26436 265 aa20.1■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa20.1■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB2Q8N680 514 aa20.1■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 IGSF21Q96ID5 467 aa20.1■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 CD244Q9BZW8 370 aa20.1■□□□□ 0.81
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IMP4-208ENST00000460766 TRBC1P01850 177 aa20.09■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 ALBP02768 609 aa20.09■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 GGT1P19440 569 aa20.09■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 HNF1BP35680 557 aa20.09■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 HPCAP84074 193 aa20.09■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 OR8J3Q8NGG0 315 aa20.09■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa20.09■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 ISOC1Q96CN7 298 aa20.09■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 ALG14Q96F25 216 aa20.09■□□□□ 0.81
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IMP4-208ENST00000460766 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa20.09■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 GSTA4O15217 222 aa20.09■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 AOC2O75106 756 aa20.09■□□□□ 0.81
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IMP4-208ENST00000460766 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
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IMP4-208ENST00000460766 AKT1P31749 480 aa20.09■□□□□ 0.81
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IMP4-208ENST00000460766 RETSATQ6NUM9 610 aa20.09■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
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IMP4-208ENST00000460766 ZNF583Q96ND8 569 aa20.09■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 PKD2L2Q9NZM6 624 aa20.09■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa20.09■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 TET1Q8NFU7 2136 aa20.09■□□□□ 0.81
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IMP4-208ENST00000460766 BPIP17213 487 aa20.08■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 CCL23P55773 120 aa20.08■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 CHRNB3Q05901 458 aa20.08■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 KIAA0040Q15053 153 aa20.08■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 CHRNA6Q15825 494 aa20.08■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 MAPKAPK3Q16644 382 aa20.08■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 TXNDC8Q6A555 127 aa20.08■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa20.08■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 TMEM150AQ86TG1 271 aa20.08■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 CLEC4FQ8N1N0 589 aa20.08■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 LIX1Q8N485 282 aa20.08■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 OR10A6Q8NH74 314 aa20.08■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 GAB3Q8WWW8 586 aa20.08■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 TMBIM1Q969X1 311 aa20.08■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 ULK4Q96C45 1275 aa20.08■□□□□ 0.81
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