RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	GTF2H3	Q13889	308 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	MFSD10	Q14728	455 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CADM2	Q8N3J6	435 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	GPR152	Q8TDT2	470 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TSGA13	Q96PP4	275 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157		A0A1B0GTL3	188 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157		H3BUI4	141 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	GJB3	O75712	270 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CNTN5	O94779	1100 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	GUCA1C	O95843	209 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ODC1	P11926	461 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	AXL	P30530	894 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PTPRN	Q16849	979 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF773	Q6PK81	442 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	NUDT8	Q8WV74	236 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	FKBP10	Q96AY3	582 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM209	Q96SK2	561 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ZBTB18	Q99592	522 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	GPR21	Q99679	349 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CYP4B1	P13584	511 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	DAG1	Q14118	895 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	XAF1	Q6GPH4	301 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ABI1	Q8IZP0	508 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SCML4	Q8N228	414 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	OR4L1	Q8NH43	312 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	OMA1	Q96E52	524 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TOR3A	Q9H497	397 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CFL2	Q9Y281	166 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	DOCK1	Q14185	1865 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	B3GALNT1	O75752	331 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	GSN	P06396	782 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ANXA6	P08133	673 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC2A4	P14672	509 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SPN	P16150	400 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CYP2C18	P33260	490 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SHMT2	P34897	504 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ATP4B	P51164	291 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TTC23	Q5W5X9	447 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	FBXL6	Q8N531	539 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CITED4	Q96RK1	184 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	EGFL8	Q99944	293 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PDE10A	Q9Y233	779 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SI	P14410	1827 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157		A0A0G2JMP0	313 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157		A0A1W2PQH9	124 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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