RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
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LIMS1-208ENST00000428064 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 CFAP206Q8IYR0 622 aa20.44■□□□□ 0.86
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LIMS1-208ENST00000428064 ACVR1CQ8NER5 493 aa20.44■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
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LIMS1-208ENST00000428064 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.44■□□□□ 0.86
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LIMS1-208ENST00000428064 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
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LIMS1-208ENST00000428064 RPA4Q13156 261 aa20.42■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 LAMB3Q13751 1172 aa20.42■□□□□ 0.86
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LIMS1-208ENST00000428064 AADACL2Q6P093 401 aa20.42■□□□□ 0.86
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LIMS1-208ENST00000428064 NAT14Q8WUY8 206 aa20.42■□□□□ 0.86
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LIMS1-208ENST00000428064 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa20.42■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 PIPSLA2A3N6 862 aa20.41■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 CDC14CA4D256 554 aa20.41■□□□□ 0.86
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LIMS1-208ENST00000428064 IZUMO3Q5VZ72 239 aa20.41■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa20.41■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM126BQ8IUX1 230 aa20.41■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 SYCE1Q8N0S2 351 aa20.41■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 UBL4BQ8N7F7 174 aa20.41■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
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LIMS1-208ENST00000428064 AMFRQ9UKV5 643 aa20.41■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa20.41■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 GSDMDP57764 484 aa20.4■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 RPS15P62841 145 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 SEMA5AQ13591 1074 aa20.4■□□□□ 0.86
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LIMS1-208ENST00000428064 STYXQ8WUJ0 223 aa20.4■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.4■□□□□ 0.86
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LIMS1-208ENST00000428064 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.4■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
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LIMS1-208ENST00000428064 AP2A2O94973 939 aa20.39■□□□□ 0.85
LIMS1-208ENST00000428064 METTL18O95568 372 aa20.39■□□□□ 0.85
LIMS1-208ENST00000428064 AP2A1O95782 977 aa20.39■□□□□ 0.85
LIMS1-208ENST00000428064 CDH3P22223 829 aa20.39■□□□□ 0.85
LIMS1-208ENST00000428064 CACNG1Q06432 222 aa20.39■□□□□ 0.85
LIMS1-208ENST00000428064 GPS2Q13227 327 aa20.39■□□□□ 0.85
LIMS1-208ENST00000428064 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
LIMS1-208ENST00000428064 PEX26Q7Z412 305 aa20.39■□□□□ 0.85
LIMS1-208ENST00000428064 TXLNBQ8N3L3 684 aa20.39■□□□□ 0.85
LIMS1-208ENST00000428064 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.39■□□□□ 0.85
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