RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366955.7

CENPF-201, Transcript of centromere protein F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPF, Length 10,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-201ENST00000366955 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa4.07□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 C3orf33Q6P1S2 294 aa4.07□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 PDSS2Q86YH6 399 aa4.07□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa4.07□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 OR4C15Q8NGM1 316 aa4.07□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 SLC25A36Q96CQ1 311 aa4.07□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 PORCNQ9H237 461 aa4.07□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 EPHX3Q9H6B9 360 aa4.07□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 GPRC5BQ9NZH0 403 aa4.07□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa4.07□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 HES2Q9Y543 173 aa4.07□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 TNS2Q63HR2 1409 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 MYH10P35580 1976 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 NPIPA5E9PKD4 350 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 L7N2F9 121 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 PPP1R37O75864 691 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 GABBR2O75899 941 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 F11P03951 625 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CHRNGP07510 517 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 MPIP34949 423 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 FAUP35544 74 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 PXNP49023 591 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 OR2B6P58173 313 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 VAMP2P63027 116 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CD47Q08722 323 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 SHHQ15465 462 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 RAET1LQ5VY80 246 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 MED27Q6P2C8 311 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ENPP6Q6UWR7 440 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 MON1BQ7L1V2 547 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 BNIPLQ7Z465 357 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 FAM126BQ8IXS8 530 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 TEX29Q8N6K0 151 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 OR5L2Q8NGL0 311 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ST7LQ8TDW4 575 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 NELL1Q92832 810 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ASPNQ9BXN1 380 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 IKZF3Q9UKT9 509 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 NPIPA1Q9UND3 350 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 NDUFAF1Q9Y375 327 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 SMCO3A2RU48 225 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 OR5F1O95221 314 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 VAPBO95292 243 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 FECHP22830 423 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ADRA1DP25100 572 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 TMBIM6P55061 237 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 GNB2P62879 340 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 KCNC4Q03721 635 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 GRIK2Q13002 908 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 OCLNQ16625 522 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 PARP15Q460N3 678 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CYP27C1Q4G0S4 372 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 Q4G0T1 1027 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 AKIRIN2Q53H80 203 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 MOXD1Q6UVY6 613 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 TMEM178AQ8NBL3 297 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 GSTCDQ8NEC7 633 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 APOL4Q9BPW4 351 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 GRIP2Q9C0E4 1043 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 FN3KQ9H479 309 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 GAREM1Q9H706 876 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 PCDH9Q9HC56 1237 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 IFT46Q9NQC8 304 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 REV1Q9UBZ9 1251 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ZNF180Q9UJW8 692 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CLEC4AQ9UMR7 237 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 RGPD5Q99666 1765 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 FAM172BPA6NC97 362 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 SNPHO15079 494 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 PSTPIP1O43586 416 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 B4GALT4O60513 344 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 APOC1P02654 83 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 TYRP14679 529 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 SHMT1P34896 483 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 MAGEA4P43358 317 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CDH4P55283 916 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 OR4D2P58180 307 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 SNAPC1Q16533 368 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 NDUFA5Q16718 116 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ELOA3BQ3SY89 546 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 LIPNQ5VXI9 398 aa4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms