RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 PHC3Q8NDX5 983 aa26.32■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 RUNDC3BQ96NL0 473 aa26.32■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM31Q9BZY9 425 aa26.32■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa26.32■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 FOXJ2Q9P0K8 574 aa26.32■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 TP73O15350 636 aa26.31■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 GSTM1P09488 218 aa26.31■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 ITPKBP27987 946 aa26.31■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 GSTM4Q03013 218 aa26.31■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 RPA4Q13156 261 aa26.31■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF789Q5FWF6 425 aa26.31■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 CTSL3PQ5NE16 218 aa26.31■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 CENPUQ71F23 418 aa26.31■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 PDZD3Q86UT5 571 aa26.31■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 HOOK3Q86VS8 718 aa26.31■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 VRK3Q8IV63 474 aa26.31■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 UNC5BQ8IZJ1 945 aa26.31■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 SPATA4Q8NEY3 305 aa26.31■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 USP7Q93009 1102 aa26.31■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM159Q96B96 161 aa26.31■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 C9orf72Q96LT7 481 aa26.31■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa26.3■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 A0A087WV48 116 aa26.3■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 C9orf172C9J069 976 aa26.3■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 PRAMEF10O60809 474 aa26.3■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 NDUFS3O75489 264 aa26.3■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 SLC5A2P31639 672 aa26.3■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 ARMC3Q5W041 872 aa26.3■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 C19orf48Q6RUI8 117 aa26.3■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 PLXDC1Q8IUK5 500 aa26.3■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 IGDCC3Q8IVU1 814 aa26.3■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 SPNS2Q8IVW8 549 aa26.3■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 AGBL5Q8NDL9 886 aa26.3■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 LPGAT1Q92604 370 aa26.3■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa26.3■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 FERD3LQ96RJ6 166 aa26.3■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 HGH1Q9BTY7 390 aa26.3■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 CDYLQ9Y232 598 aa26.3■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa26.3■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 MAGEB16A2A368 324 aa26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 EFCAB7A8K855 629 aa26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 PAMP19021 973 aa26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 ACADLP28330 430 aa26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 CD151P48509 253 aa26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 SYTL3Q4VX76 610 aa26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 MRNIPQ6NTE8 343 aa26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 NEPROQ6NW34 567 aa26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 IRGCQ6NXR0 463 aa26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 FAM92BQ6ZTR7 304 aa26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 PCGF5Q86SE9 256 aa26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 FAM129CQ86XR2 697 aa26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 DENND6AQ8IWF6 608 aa26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 BMPERQ8N8U9 685 aa26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 BIRC8Q96P09 236 aa26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 PLAC1Q9HBJ0 212 aa26.29■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 USP1O94782 785 aa26.28■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 FMO4P31512 558 aa26.28■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 ITGA8P53708 1063 aa26.28■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 KRT33BQ14525 404 aa26.28■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 MORF4L2Q15014 288 aa26.28■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 BBS9Q3SYG4 887 aa26.28■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF470Q6ECI4 717 aa26.28■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 CILP2Q8IUL8 1156 aa26.28■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 OR5AR1Q8NGP9 310 aa26.28■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 CRELD1Q96HD1 420 aa26.28■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 CARD6Q9BX69 1037 aa26.28■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa26.28■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 OR5K3A6NET4 321 aa26.27■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 OGNP20774 298 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 RPL21P46778 160 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 HSPA14Q0VDF9 509 aa26.27■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 PRKG2Q13237 762 aa26.27■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 OR52E1Q8NGJ3 308 aa26.27■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 ART4Q93070 314 aa26.27■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 FAM136AQ96C01 138 aa26.27■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 EPHA6Q9UF33 1036 aa26.27■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 GNPTGQ9UJJ9 305 aa26.27■■□□□ 1.8
TPGS1-201ENST00000359315 CRYL1Q9Y2S2 319 aa26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms