RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
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TNFRSF25-201ENST00000348333 PHC3Q8NDX5 983 aa22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR4E2Q8NGC2 313 aa22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 UBXN4Q92575 508 aa22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF778Q96MU6 729 aa22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCM2Q9BSQ5 444 aa22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 STARD5Q9NSY2 213 aa22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 CROTQ9UKG9 612 aa22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 KLHL33A6NCF5 533 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 TLCD2A6NGC4 264 aa22.13■■□□□ 1.13
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TNFRSF25-201ENST00000348333 KRT86O43790 486 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 FOXN2P32314 431 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 DLSTP36957 453 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 KLHL35Q6PF15 583 aa22.13■■□□□ 1.13
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TNFRSF25-201ENST00000348333 PPP1R3BQ86XI6 285 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR13J1Q8NGT2 312 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 HEXDCQ8WVB3 486 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 FERD3LQ96RJ6 166 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 RUFY1Q96T51 708 aa22.13■■□□□ 1.13
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TNFRSF25-201ENST00000348333 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF148Q9UQR1 794 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa22.12■■□□□ 1.13
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TNFRSF25-201ENST00000348333 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC28A2O43868 658 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 POLE2P56282 527 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 GPR19Q15760 415 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 C16orf46Q6P387 395 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 DNAAF3Q8N9W5 541 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 CD180Q99467 661 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 FGF21Q9NSA1 209 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 J3QKU1 62 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 BTN3A3O00478 584 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 SUN1O94901 812 aa22.11■■□□□ 1.13
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TNFRSF25-201ENST00000348333 GSDMDP57764 484 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDH17Q12864 832 aa22.11■■□□□ 1.13
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TNFRSF25-201ENST00000348333 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa22.11■■□□□ 1.13
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TNFRSF25-201ENST00000348333 BRD3Q15059 726 aa22.1■■□□□ 1.13
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TNFRSF25-201ENST00000348333 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM135Q86UB9 458 aa22.1■■□□□ 1.13
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TNFRSF25-201ENST00000348333 ARL4DP49703 201 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 HSD11B2P80365 405 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCNAB2Q13303 367 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 TSTD2Q5T7W7 516 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARMC6Q6NXE6 501 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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