RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 ORC5O43913 435 aa6.26□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 NDUFV1P49821 464 aa6.26□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 AP3S2P59780 193 aa6.26□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 DSC2Q02487 901 aa6.26□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 NPTX1Q15818 432 aa6.26□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.26□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 PARP15Q460N3 678 aa6.26□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.26□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 RFKQ969G6 155 aa6.26□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.26□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.26□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.26□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 NID2Q14112 1375 aa6.26□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 ELFN1P0C7U0 828 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 CCR10P46092 362 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 CDH12P55289 794 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 MAZP56270 477 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 PCDH1Q08174 1060 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 RBBP4Q09028 425 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 VGLL4Q14135 290 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 ULK3Q6PHR2 472 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 SLIT3O75094 1523 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 CLIC3O95833 236 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 SMCO1Q147U7 214 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 FKBP1CQ5VVH2 108 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 CHSY3Q70JA7 882 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 PARGQ86W56 976 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 ZFP3Q96NJ6 502 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 DPEP3Q9H4B8 488 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 TAS2R7Q9NYW3 318 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 H3BM21 787 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 AURKAO14965 403 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 IFNA16P05015 189 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 LINGO3P0C6S8 592 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 C2orf80Q0P641 193 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.411e-16■□□□□ 8.5
SBNO1-201ENST00000267176 CPNE9Q8IYJ1 553 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 OR9I1Q8NGQ6 314 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 EMC3Q9P0I2 261 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 UBR1Q8IWV7 1749 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 AQP12BA6NM10 295 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF432O94892 652 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 TFPTP0C1Z6 253 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 ITIH1P19827 911 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 PCLAFQ15004 111 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 SYCE2Q6PIF2 218 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 AQP12AQ8IXF9 295 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 URADA6NGE7 173 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 CXCL11O14625 94 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 ACOX3O15254 700 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 HCN1O60741 890 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 PRLP01236 227 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 DNTTP04053 509 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 HSPB3Q12988 150 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 NPY5RQ15761 445 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 RTL4Q6ZR62 310 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 SLC9A6Q92581 669 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 TMEM203Q969S6 136 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 ARL5AQ9Y689 179 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 CLPXO76031 633 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 ENTPD1P49961 510 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 TRPV3Q8NET8 790 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 XPNPEP2O43895 674 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 NME6O75414 186 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 CES1P23141 567 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-201ENST00000267176 DUSP4Q13115 394 aa6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms