RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262435.13

SMURF2-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2-201ENST00000262435 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
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SMURF2-201ENST00000262435 CD300CQ08708 224 aa15.49■□□□□ 0.07
SMURF2-201ENST00000262435 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
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SMURF2-201ENST00000262435 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
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SMURF2-201ENST00000262435 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
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SMURF2-201ENST00000262435 CKBP12277 381 aa15.48■□□□□ 0.07
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SMURF2-201ENST00000262435 PLA2G16P53816 162 aa15.48■□□□□ 0.07
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SMURF2-201ENST00000262435 ACTR8Q9H981 624 aa15.48■□□□□ 0.07
SMURF2-201ENST00000262435 PFDN4Q9NQP4 134 aa15.48■□□□□ 0.07
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SMURF2-201ENST00000262435 FNIP2Q9P278 1114 aa15.48■□□□□ 0.07
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SMURF2-201ENST00000262435 PERM1Q5SV97 790 aa15.47■□□□□ 0.07
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SMURF2-201ENST00000262435 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SMURF2-201ENST00000262435 WWOXQ9NZC7 414 aa15.47■□□□□ 0.07
SMURF2-201ENST00000262435 FBXO10Q9UK96 956 aa15.47■□□□□ 0.07
SMURF2-201ENST00000262435 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SMURF2-201ENST00000262435 PTPRDP23468 1912 aa15.47■□□□□ 0.07
SMURF2-201ENST00000262435 TRIM64CA6NLI5 447 aa15.47■□□□□ 0.07
SMURF2-201ENST00000262435 SLC38A8A6NNN8 435 aa15.47■□□□□ 0.07
SMURF2-201ENST00000262435 LOC730098B7Z3J9 87 aa15.47■□□□□ 0.07
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