RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000057254.5

Ubqln3-201, Transcript of Ubiquilin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubqln3, Length 2,376 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ankrd7Q9D504 279 aa8.71□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Dusp26Q9D700 211 aa8.71□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Echdc3Q9D7J9 300 aa8.71□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Efhd2Q9D8Y0 240 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Fam13cQ9DBR2 601 aa8.71□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Csnk1dQ9DC28 415 aa8.71□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Noa1Q9JJG9 693 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Nectin1Q9JKF6 515 aa8.71□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Epb41l1Q9Z2H5 879 aa8.71□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Plxna2P70207 1894 aa8.71□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Nup210Q9QY81 1886 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gm13089A2AGW7 455 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Vmn2r65G3X931 845 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ebf3O08791 596 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 CflarO35732 481 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Mllt10O54826 1068 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Fv4P11370 679 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Esr1P19785 599 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 BdnfP21237 249 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Pxmp2P42925 194 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Rpl26P61255 145 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Fmo5P97872 533 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Pfdn6Q03958 127 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Q3KNL4 93 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Q3TYS2 187 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Esrp1Q3US41 680 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Cdkn2cQ60772 168 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Lcp2Q60787 533 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Pou4f2Q63934 411 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Bnip1Q6QD59 228 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Olfr735Q7TRM4 354 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Coq4Q8BGB8 266 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Cops7bQ8BV13 264 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Znf385bQ8BXJ8 482 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ankrd49Q8VE42 238 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Mtif2Q91YJ5 727 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 NlnQ91YP2 704 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Prpf19Q99KP6 504 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Moxd1Q9CXI3 613 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Mrpl45Q9D0Q7 306 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Hormad1Q9D5T7 392 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Fam162aQ9D6U8 155 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Tbc1d21Q9D9D3 336 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Dnajb1Q9QYJ3 340 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ppm1dQ9QZ67 598 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Tnrc18Q80WC3 2878 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gm7792A0A0J9YU01 481 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ttc30a2A2AKQ8 664 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Cldn34b1B1AZQ8 209 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Fam71f2B2RXB0 297 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gm3183D3YUJ6 481 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Zfp846G3X996 541 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gm3139J3QK78 481 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gm3106J3QPH3 481 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gnao1P18872 354 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Pou2f3P31362 431 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Arl1P61211 181 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 TgfbiP82198 683 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Tmem173Q3TBT3 378 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Coq10bQ3THF9 240 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Rnf145Q5SWK7 663 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 PtprnQ60673 979 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 XiapQ60989 496 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Xlr3cQ61806 226 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 ThrspQ62264 150 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Med26Q7TN02 588 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 IpmkQ7TT16 396 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 CpmQ80V42 443 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Tmem121Q80XA0 318 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Elp6Q8BK75 266 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Cers6Q8C172 384 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Kremen2Q8K1S7 461 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Vmn1r22Q8R2D1 302 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Nudt4Q8R2U6 179 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Dhcr24Q8VCH6 516 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Micu1Q8VCX5 477 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 TMEM121BQ99MX7 572 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Fam136aQ9CR98 138 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Q9D1F3 157 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Snrnp48Q9D361 337 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Clic3Q9D7P7 237 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Glod5Q9D8I3 148 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Cldn34b2Q9D9N2 209 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ddi1Q9DAF3 408 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Uba7Q9DBK7 977 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 C1qtnf3Q9ES30 246 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ap1m2Q9WVP1 423 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Glipr1l3A0A1W2P7V2 236 aa8.69□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gm14459A2BI73 179 aa8.69□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 CatsperbA2RTF1 1109 aa8.69□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Sec14l5B2RXM5 696 aa8.69□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gm6356L7N2A7 188 aa8.69□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Kpna4O35343 521 aa8.69□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Cyp2b19O55071 492 aa8.69□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Tcf3P15806 651 aa8.69□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 ItgalP24063 1163 aa8.69□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Csf2rb2P26954 878 aa8.69□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Tnfsf4P43488 198 aa8.69□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Yap1P46938 488 aa8.69□□□□□ -1.02
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Inpp1P49442 396 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.7 ms