RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587256.1

ATG4D-207, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-207ENST00000587256 FAM129CQ86XR2 697 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 PLXDC1Q8IUK5 500 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 CPT1BQ92523 772 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 SAMD15Q9P1V8 674 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 F8W8V4 182 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 GSTM1P09488 218 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 OR56A5P0C7T3 313 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 NMBRP28336 390 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 SLC5A2P31639 672 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 ETV5P41161 510 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 PREPP48147 710 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 GFERP55789 205 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 GSTM4Q03013 218 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 TMEM164Q5U3C3 297 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 ELMO1Q92556 727 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 RSC1A1Q92681 617 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 TGM7Q96PF1 710 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 TREX1Q9NSU2 369 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 WDR70Q9NW82 654 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 OGFRQ9NZT2 677 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 ASIC3Q9UHC3 531 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 SAR1BQ9Y6B6 198 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 PRSS21Q9Y6M0 314 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 EFCAB7A8K855 629 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 OR1I1O60431 355 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 PRAMEF10O60809 474 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 AVILO75366 819 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 CCL4P13236 92 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 ITPKBP27987 946 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 SEMA3AQ14563 771 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 COL28A1Q2UY09 1125 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 IRGCQ6NXR0 463 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 KLHL35Q6PF15 583 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 CES3Q6UWW8 571 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 XKR5Q6UX68 686 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 USP7Q93009 1102 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 KIFC1Q9BW19 673 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 TSSK1BQ9BXA7 367 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 PDP2Q9P2J9 529 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 SOX13Q9UN79 622 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 NEU2Q9Y3R4 380 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 DSPP15924 2871 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 KLK10O43240 276 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 RASSF9O75901 435 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 MLNP12872 115 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 PAMP19021 973 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 NDUFS1P28331 727 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 PAFAH1B1P43034 410 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 TTPAP49638 278 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 RPA4Q13156 261 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 BRD3Q15059 726 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 BROXQ5VW32 411 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 PDZD3Q86UT5 571 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 KLHL7Q8IXQ5 586 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 MPP5Q8N3R9 675 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 MCUQ8NE86 351 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 ART4Q93070 314 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 MFSD3Q96ES6 412 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 ZDHHC12Q96GR4 267 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 SGSM3Q96HU1 749 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 SERPINB12Q96P63 405 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 OR52A5Q9H2C5 316 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 FOXJ2Q9P0K8 574 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 LHX6Q9UPM6 363 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 NVLO15381 856 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 NDUFS3O75489 264 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 VAPBO95292 243 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 C9P02748 559 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 ANKRD34CP0C6C1 535 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 ITGB6P18564 788 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 PDHA2P29803 388 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 TLE3Q04726 772 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4D-207ENST00000587256 PTK6Q13882 451 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms