RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583282.5

GGA3-216, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-216	ENST00000583282	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	MAPK15	Q8TD08	544 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	TMEM159	Q96B96	161 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	VPS39	Q96JC1	886 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	C12orf66	Q96MD2	445 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	GPR21	Q99679	349 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	CPNE1	Q99829	537 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	GALP	Q9UBC7	116 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	CPED1	A4D0V7	1026 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	CBFA2T3	O75081	653 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	VPS26A	O75436	327 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	APOA4	P06727	396 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	SLC2A4	P14672	509 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	BRAF	P15056	766 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	MCM3	P25205	808 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	PDHA2	P29803	388 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	CDKN2D	P55273	166 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	NAB1	Q13506	487 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	CLCA4	Q14CN2	919 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	GALNT7	Q86SF2	657 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	PIP4P1	Q86T03	277 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	VRK3	Q8IV63	474 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	ZBTB2	Q8N680	514 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	GLMN	Q92990	594 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	RBBP8	Q99708	897 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	SLC30A3	Q99726	388 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	OLFM1	Q99784	485 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	ZMYND15	Q9H091	742 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	SLC32A1	Q9H598	525 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282		U3KQA8	63 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	KLHL33	A6NCF5	533 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	GIPC1	O14908	333 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	KCNJ13	O60928	360 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	ABHD2	P08910	425 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	GSTM1	P09488	218 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	AOAH	P28039	575 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	RPIA	P49247	311 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	GSTM4	Q03013	218 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	BMPR2	Q13873	1038 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	ZNF460	Q14592	562 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	METRNL	Q641Q3	311 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	PDZD3	Q86UT5	571 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	GPR156	Q8NFN8	814 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	IFI44	Q8TCB0	444 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	CD200R1	Q8TD46	325 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	KCNJ9	Q92806	393 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	CYTH2	Q99418	400 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	PAFAH2	Q99487	392 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	HGH1	Q9BTY7	390 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	MED16	Q9Y2X0	877 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	LAMA1	P25391	3075 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-216	ENST00000583282	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		13.71	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms