RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa3.01□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 CAMK2AQ9UQM7 478 aa3.01□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 DGKBQ9Y6T7 804 aa3.01□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 UNC80Q8N2C7 3258 aa3.01□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 CEP152O94986 1710 aa3.01□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 PTPRUQ92729 1446 aa3.01□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 CNTNAP1P78357 1384 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 CRLF1O75462 422 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SEC14L2O76054 403 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 NKX2-2O95096 273 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 CLPTM1O96005 669 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 TFAP2AP05549 437 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 IL7RP16871 459 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 MSH3P20585 1137 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 ITGA3P26006 1051 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 CTSCP53634 463 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 DUOXA1Q1HG43 343 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 CDONQ4KMG0 1287 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 RAB6CQ53S08 254 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 TCTE1Q5JU00 501 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 METTL7BQ6UX53 244 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 MFSD6Q6ZSS7 791 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 ATG9AQ7Z3C6 839 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 PAF1Q8N7H5 531 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 HTRA1Q92743 480 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 FAM149B1Q96BN6 582 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 POM121L2Q96KW2 1035 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 TMEM39BQ9GZU3 492 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 RAB6CQ9H0N0 254 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 PPCSQ9HAB8 311 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SLC7A10Q9NS82 523 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 BARHL2Q9NY43 387 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 KLHL9Q9P2J3 617 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SLC13A4Q9UKG4 626 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 CAPN7Q9Y6W3 813 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 PRXQ9BXM0 1461 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 KIF15Q9NS87 1388 aa3□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SBF2Q86WG5 1849 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 DUXAA6NLW8 204 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 DCXO43602 365 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 PAGE4O60829 102 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 DAB1O75553 588 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 FAM157CP0CG43 387 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 CEACAM1P13688 526 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 LIFP15018 202 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 XBP1P17861 261 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SP100P23497 879 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 ABCD3P28288 659 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 MAP2K2P36507 400 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 RARSP54136 660 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 KCNJ10P78508 379 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 ADIPOQQ15848 244 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 CCNG2Q16589 344 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 DPCR1Q3MIW9 517 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 ZNF805Q5CZA5 627 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SH2D5Q6ZV89 423 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 ARMC8Q8IUR7 673 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 ZNF440Q8IYI8 595 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 GBGT1Q8N5D6 347 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SLC5A8Q8N695 610 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 GCSAMQ8N6F7 178 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 EMC1Q8N766 993 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SLC38A9Q8NBW4 561 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 ST8SIA4Q92187 359 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SGCDQ92629 289 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 FAM122AQ96E09 287 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 MAP7D2Q96T17 732 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 EGFL8Q99944 293 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SLC38A7Q9NVC3 462 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 CACNG5Q9UF02 275 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 FBXW11Q9UKB1 542 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 MKLN1Q9UL63 735 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 KCNJ14Q9UNX9 436 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 RIMS2Q9UQ26 1411 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 PAPPAQ13219 1627 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 C1orf226A1L170 272 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 MEIOCA2RUB1 952 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 MAP2K7O14733 419 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 ATP2A1O14983 1001 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SLC25A12O75746 678 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 WISP2O76076 250 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 EML2O95834 649 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 LIPFP07098 398 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 DPEP1P16444 411 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms